一）底层充气，以保持下层水体有适度的活性污泥
藻类在水上层净水，而下层则靠微生物净水。当底泥沉在池底时，表面有少量的微生物，其净水能力很弱，当底层充气后底泥悬在水体中，每个泥土颗粒的表面就有大量的微生物包裹，形成“活性底泥”，其净水能力提高数千倍，可见水体下层保持适度的“活性底泥”对提高池塘净水能力意义非常重要。
二）适当补充可溶性有机肥水育藻剂，以保证藻类、微生物正常营养需要
氨氮、有机物过高不好，但没有也不行，因为藻类、有益微生物要靠这些东西生存，因而保持适当的氨氮、有机物浓度也是必须的。在营养不足、藻类老化或新挖池塘放苗初期用氨基酸营养膏迅速肥水，调整水色到有益状态。
三）有效改底，防止底臭
养殖动物多在底层生活，对他们而言，底质的好坏则影响非常之大。我们经常遇到的虾“游塘”，虾“黄腿”，很多都是底质恶化的结果，如果底质好即使出现“下大雨”等异常天气，也不会造成溶氧的迅速降低或有害物质的迅速提高，“底质直接影响水体的稳定及养殖动物的生长及抗病力等”，因此底质消毒与改良具有重要的意义。
底臭常见的原因：
1、养殖水深与增氧能力不符，造成底层溶氧不足，底泥发臭。生产中常见到水深超过1.2米的池塘没有增氧设备，或水深在1.5米以上的池塘仅有水车式增氧机，这些池塘底层溶氧会经常不足，夏季因存在“温跃层”则更易出现问题。
2、投饵量较大、饵料利用率较低或喂螺、蚌的池塘。过多摄食则造成养殖动物消化不良，以致底质中有大量的饵或粪便残留，易发臭。
3、砂底池塘。由于砂质颗粒较大，吸附氨等有害物质的能力较差，易发臭。
4、水较瘦或老化的池塘。藻类逃命作用差，不仅溶氧低，且有害物质分解速度降低，底泥易发臭。
5、不适当的用药。如经常使用消毒剂，破坏水体的自净能力，氨等有害物质会迅速升高。又如经常使用以沸石粉、木炭等吸附性物质为主的“底改”，造成底质中大量的有害物质沉积，底泥也易发臭。
防止底泥发臭的方法：
1、底泥充气，促进有益菌的繁殖，是减少底臭较好的方法。
2、采取定点及少量多餐的投饵方式，避免残饵的形成及提高饵料转换率。
3、定向培养有益藻类，用氨基酸营养膏培养有益藻类，并防止水体老化。
4、不用砂底养虾，定期使用佳底氧、分解底改王，以调高底泥通透性，改善底层溶氧状态。
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