微孢子虫在动物界中是分布很广的一类微小寄生虫，寄生在很多动物类群中，主要危害鱼类、昆虫和甲壳动物，是水产动物寄生虫病中危害较大的疾病，至今尚无有效的治疗方法。
(一)病原
微孢子虫属孢子虫类。孢子呈梨形、卵圆形、椭圆形或茄形等，孢子小，长2-10微米。内部构造必须在电镜下才能看清楚。孢子外面有3层组成的胞膜，前端有一极帽；极泡的前部呈松散的薄片状，易染色，极泡的后部呈颗粒状，不易着色；极泡的功能可能是在膨胀时将极丝和孢质挤出孢子外；极丝呈管状，基部附着在极帽上，极丝斜行穿过极泡，然后呈螺旋状盘绕在孢质和极泡后部的周围，末端膨大成杯状或囊状；有1个核。危害较大的常见种类有：
(1)微粒子虫每个母孢子产生1个孢子。
(2)格留虫每个母孢子产生2个孢子。
(3)特汉虫(又称狄鲁汉虫)每个母孢子产生8个孢子。
(4)匹里虫每个母孢子产生16个以上孢子。如危害鳗鲡的鳗匹里虫，孢子呈梨形或椭圆形，前端稍窄，后端钝圆，大小为7.4×4.3微米，极丝不易看到，极丝长399-435微米。孢囊球形，大小为0.3毫米.最小的只有40微米，孢囊内可看到产孢子、泛孢子母细胞和孢子。
(二)流行情况及症状
淡水鱼类的微孢子虫病主要有以下三种：
1.鳗匹里虫病由鳗匹里虫寄生在鳗鲡的肌肉内引起的疾病。在全长10厘米左右的鳗鲡患病后，可见黄白色斑，体表凹凸不明显；大的鳗鲡患病时，则可看到躯干部凹凸不平。凸处稍硬，凹处柔软；剖开鱼体，可见凸处肌肉中寄生的匹里虫远比凹处为多。在加温的养鳗池内，白仔鳗就有患病的。严重感染时，病鱼消瘦，不摄食，游动缓慢，以致死亡。尤其是对幼鳗危害为大，即使不死，也不能育成有商品价值的食用鳗。在日本及我国均有流行。将孢子放入水中，或拌入饲料中投喂，都可以引起鳗鲡感染发病。因此，该病可能是经口及经皮肤感染。
2.虹鳟格留虫病格留虫寄生在虹鳟的心肌、大侧肌(体侧肌)、食道肌、咽喉肌、咬肌、鳍肌及动脉肌等处引起的疾病。大量寄生时可引起心脏整个肿大，表面稍有突起，心脏的重量有时可达健康鱼的2倍左右；体侧肌中出现白斑，体表有轻度的起伏不平；病鱼食欲减退，消瘦，个体很小，眼球突出，可引起鱼种大量死亡。对2龄以上的大鱼，一般不引起死亡，在外表也无明显症状；只有解剖后，才可看到心脏肿大、变形，表面有大小不等的白色突起。水温上升到15℃时发病。该病流行于日本，要严防传入我国。
3.赫氏格留虫病赫氏格留虫寄生在草鱼、鳙、鲢、鲤、鲫、鳊、斑鳢等的肾脏、肠、生殖腺、脂肪组织、鳃和皮肤等处引起的疾病。在格留虫寄生处形成白色胞囊，严重时可影响性腺发育和生长。在我国各养鱼地区都有发生，但至今尚未有引起病鱼大量死亡的病例报道。
(三)诊断
(1)根据症状及流行情况进行初步诊断。
(2)最后需取病灶处压片，用显微镜检查，进行诊断。
(四)预防措施
(1)彻底清塘。
(2)据国外报道，池子予以干燥或在50℃经数分钟后，可杀死孢子。
(3)据国外报道，每立方米水体加十六烷吡啶氯化物100克，3分钟可杀死孢子。
(4)加强饲养管理，进行综合预防，保持优良水质，提高鳗鲡抵抗力。
(五)治疗方法
至今尚无理想的治疗方法，据何筱洁等(1994)介绍：每千克鱼每天用烟曲霉素50毫克拌饲投喂，连喂20天，有一定效果。
