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山茱萸是山茱萸科的植物，吴茱萸是芸香科的植物，从形态上来看，山茱萸和吴茱萸也是不同的，比如山茱萸的核果为紫红色，比较饱满且富有光泽，整体是呈长椭圆形的，而吴茱萸的果实是有大油点，看起来像小瘤子，表面不光滑也不艳丽。
山茱萸和吴茱萸是不一样的，虽然两者都是可以入药的，但是他们有着不同性味、不同功效、不同归经，在植物形态上也是完全不一样的。
山茱萸是山茱萸科的植物，其干燥的成熟果肉是可以入药的，归肾、肝经，含有苷类、鞣质类、有机酸、氨基酸等成分，入药后有着补益肝肾的作用。
吴茱萸是芸香科的植物，其干燥果实可以入药，多在8-11月份进行采收，归肝、脾、胃、肾经，制药前要除去其杂质，有着散寒止痛的功效。
1、种属不同
山茱萸是山茱萸科的植物，属于落叶灌木，又叫做蜀酸枣、天木籽、肉枣、山芋肉、薯枣、鸡足等，而吴茱萸是芸香科的一种植物，又叫做吴萸、米辣子、漆辣子等。
2、形态不同
从形态上来看，山茱萸和吴茱萸也是不同的，比如山茱萸的核果为紫红色，比较饱满且富有光泽，整体是呈长椭圆形的，而吴茱萸的果实是有大油点，看起来有点像小瘤子，表面不光滑也。
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