一、施肥要适期：子实体的生长发育需要利用培养料中的养分。每出菇一批都要消耗掉较大一部份养分。因此，菌床施肥最适宜补充期是在采菇一批后到下一批菇出现前这段时间内，也就是通常所说的转潮期。另外，子实体幼嫩期对外界养分有一定的吸收功能，故在蕾期也要适当施肥。
二、肥料应合理搭配或交替使用：食用菌的生长，不但需要大量的碳、氮、磷、钾等元素，还需要一定数量的微量元素；此外，细胞激素等生长激素对食用菌的生长发育也有重要的影响，故在施肥过程中，肥料应合理搭配使用或交替使用。
三、肥液浓度要适当：肥液浓度过高，养分不但没有被菌丝吸收，反而会妨碍菌丝的正常生长；浓度过低，则难以发挥应有的效应。在常用肥液中，有机肥料的浓度一般掌握在2%左右；糖类的浓度以0.1-0.3%为宜；尿素的浓度应掌握在0.1-0.3%；磷、钾、镁等无机盐的浓度宜在0.05-0.1%之间；锌、锰、硼、钼等微量元素的浓度可在0.02-0.05%之间，生长素的浓度因种类而不同，一般浓度在0.5-5ppm之间。
