猝倒病薄皮甜瓜苗期常见病害，此病害在低温、高湿阴雨、幼苗纤弱的情况下易发生。发病初期呈黄色水浸状病斑，病部逐渐干枯，最终猝倒死亡，病株周围长出白色棉絮状菌丝。防治猝倒病可用64%杀毒矾M8可湿性粉剂500倍液、25%瑞毒霉可湿性粉剂600～800倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液等药剂。
枯萎病甜瓜易发性土传病害，一般坐果中期发病最为严重。发病时茎基部缢缩、纵裂并有黄褐色胶汁溢出，叶脉发黄，初期整株萎蔫早晚可恢复，后期全株死亡。枯萎病发病适温24℃～28℃，连作、黏质、排水不良等地块极易发病。田间一旦发现病株，可用70%甲基托布津可湿性粉剂1000～1500倍液、40%瓜枯宁1000倍液或60%百菌通可湿性粉剂400～500倍液等药剂灌根防治。
霜霉病俗称“跑马干”、“黑毛病”，为毁灭性叶部病害。发病初期叶片出现水浸状黄色斑点，后扩展为黄褐色不规则多角形斑块，潮湿时病斑背部有灰色霉层。霜霉病发病适温20℃～24℃，发病后要及时用25%瑞毒霉可湿性粉剂500倍液、25%甲霜灵500倍液、75%百菌清600倍液、58%甲霜灵锰锌400倍液或90%疫霜灵500倍液来防治，根据病情一周喷洒一次。
白粉病主要为害叶片、叶柄、茎蔓，结果期至成熟期易发生。发病初期叶上出现白色粉状小点，后扩大成白色霉层，后期叶柄、茎蔓蔓延，严重时整株被霉层覆盖。白粉病可用75%百菌清500～800倍液、50%硫悬浮剂200～400倍液或40%多硫悬浮剂喷洒，也可用45%百菌清烟剂或硫磺粉200～250克密闭熏蒸。
蚜虫蚜虫在叶背和嫩梢、嫩茎上吸食汁液。叶片被侵害后卷缩，生长停滞，严重影响生长坐果。化学法防治蚜虫可用一遍净、吡虫啉等药剂喷洒，也可用黄板诱杀等生物学方法防治。
白粉虱白粉虱汲取植物汁液，受害叶片褪绿、变黄、萎蔫，甚至全株枯死。白粉虱分泌大量蜜液，严重污染叶片和果实，诱发煤污病，妨碍光合作用，传播病毒病，影响产量和品质。防治白粉虱可用扑虱灵、蚜虱首击等喷洒。
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