1，杀菌谱的差异：戊唑醇的杀菌谱要比烯唑醇少，戊唑醇对白粉菌属，柄锈菌属等病害有效。2，杀菌活性的差异：戊唑醇的杀菌活性不如烯唑醇强，其内吸性也低于烯唑醇。3，抑制作用的差异：三唑类杀菌剂对植株都有一定的抑制作用，在这方面，烯唑醇对抑制植株生长的作用要比戊唑醇强。
作物生长发育期间，会受到病菌的侵染，我们会使用一些杀菌剂来处理植物及其生长的环境，以减少或消灭病菌或改善植物的生长环境，提高其抗病能力，从而达到预防或阻止病害的发生和发展，这就叫植物病害的化学防治。
我们所用的杀菌剂有很多种，有真菌性杀菌剂，细菌性杀菌剂，病毒类杀菌剂等，它们有保护性的，治疗性的，铲除性的等，有内吸和非内吸之分。主要作用就是抑制或干扰病菌能量的生成，抑制或干扰病菌的生物合成，对病菌的间接作用等。
如戊唑醇和烯唑醇，它俩都是三唑类杀菌剂，都是高效广谱内吸性杀真菌剂，具有保护，治疗的作用。
它俩的相同点除此之外，还具有向植株顶部传导的特性，防徒长，促进花芽分化，使植株根系发达，叶色浓绿，健壮，有效分蘖增加，从而提高产量等作用。
而它俩也有不同点，主要是:
1，杀菌谱的差异
戊唑醇的杀菌谱要比烯唑醇少，戊唑醇对白粉菌属，柄锈菌属等病害有效，如小麦白粉病，小麦散黑穗病，小麦纹枯病，雪腐病，全蚀病，腥黑穗病，云纹病，玉米丝黑穗病，高梁丝黑穗病，锈病，赤霉病，苹果褐斑病等有效。
而烯唑醇对子囊菌，如缩叶病，白粉病，黑斑病，赤霉病，腐烂病，黑星病，菌核病；担子菌，如黑粉病，锈病，纹枯病，以及半知菌的腐霉病，疫霉病，霜霉病和白锈病等特效。
烯唑醇主要适用于防治麦类散黑穗病，腥黑穗病，坚黑穗病，白粉病，条锈病，叶锈病，秆锈病，云纹病，叶枯病，高梁丝黑穗病，花生褐斑病，黑斑病，苹果白粉病，锈病，梨黑星病以及咖啡，蔬菜等的白粉病，锈病等病害。
2，杀菌活性的差异
戊唑醇的杀菌活性不如烯唑醇强，其内吸性也低于烯唑醇。
烯唑醇具有较高的杀菌活性和内吸性，植物的种子，根，叶片均能吸收，对病菌孢子的萌发抑制作用小，但能明显抑制萌芽后芽管的伸长，吸器的形状，菌体在植物体内的发育，新孢子的形成等。
但戊唑醇的杀菌速度要比烯唑醇快，戊唑醇可杀灭侵入植株体内的病菌，而烯唑醇是靠抑制病菌的生长，最终导致病菌的生物合成受阻而亡。在作用速度上不如戊唑醇快。
3，抑制作用的差异
三唑类杀菌剂对植株都有一定的抑制作用，在这方面，烯唑醇对抑制植株生长的作用要比戊唑醇强。
像花生，地瓜等作物，可以用烯唑醇控旺，而且又杀菌，其控旺防徒长的能力要比戊唑醇好。
既然烯唑醇有如此多的好处，为什么烯唑醇的应用量比戊唑醇少呢？
因为，烯唑醇不宜长时间，单一使用，否则容易使病原菌产生抗药性，而且其抑制生长的作用更强，所以在实际农业生产中，用戊唑醇的量要比烯唑醇多。
但不管怎样说，戊唑醇和烯唑醇，以及丙环唑，氟环唑，苯醚甲环唑，三唑酮等三唑类杀菌剂，一般幼苗期不宜使用，或不宜过量多次使用，以防抑制生长。
在作物其它生育期内使用时，也最好是很其他不同杀菌机理的杀菌剂复配使用，以减轻抗药性的发生。
