幼苗根系发达，呈白色，并能紧密缠绕基质成团，株高约20厘米，茎粗约0.3厘米，6～7片真叶，叶色深绿有光泽，叶片大而肥厚，无病虫害的秧苗，为甜椒壮苗。甜椒育苗可在日光温室内采用工厂化集约化栽培，苗龄65天左右。
甜椒播种前，应对棚室使用化学药剂或者臭氧发生器等进行全面消毒，使用药剂对育苗用具、穴盘等进行消毒。常用40%甲醛150倍液进行浸泡消毒处理后再用清水冲洗、晾干，直至药气消失后进行育苗。
选在晴天中午前后进行播种。将装好基质的穴盘用相同的穴盘重叠进行压穴，压好后进行播种。根据种子质量灵活调整，每穴播1～2粒种子，平放在穴孔中间，播完后覆盖基质或者已消毒的蛭石并刮平。将播好的育苗盘平放在苗床上，喷透水，覆盖一层薄膜，保温保湿。
当70%苗出土后揭去薄膜，幼苗生长期白天温度为25℃～27℃，夜间18℃～20℃，日平均温度为19℃～21℃、空气湿度以70%～80%为宜。早春育苗在保证温度的前提下，白天早揭晚盖覆盖物以增加光照，连阴天要适时进行补光。10天左右苗出齐后，结合天气情况适时适度浇水，保持基质湿润。结合喷水5～7天浇1次肥水，可选用育苗专用水溶肥等优质肥料。2片真叶后开始适当控制水分，防止幼苗徒长苗。第3片真叶正在展开时，花芽开始形成。出棚前应喷施广谱性杀菌剂，进行预防性病害防治。
