在农业生产中，施肥是不可缺少的，特别是化肥的施用，在现代农业生产中起着重大的作用。合理施肥可促使作物的正常代谢，增加作物的产量和作物的抗逆性。如施肥不当，会引起作物代谢失调，导致病虫害的发生。
一般来说，施用氮素过多会引起作物的叶色深绿，大部分碳水化合物用于氮的同化，使纤维素、木质素的合成减少，植物徒长细软，抗倒伏能力弱，并因体内有较多的可溶性氮积累而使农作物易感病害。氮肥过多抗病能力也相应减弱，。合理的氮、磷、钾配合施用，增施硼、锌、锰等微量元素，可促进农作物的生理代谢，增强植物的抗逆性，减轻病虫害的发生。如磷可促进农作物的根系发育，硼锰可减少棉花枯黄萎病的发生。在缺钾土壤中施用适量的钾肥，一般能减轻真菌和细菌性病害，对虫害和螨害也有一定的效果。一般而言，当钾供给适当时，可减少水稻胡麻叶斑病、条叶枯病、稻瘟病、纹枯病的发生。少麦类赤霉病、纹枯病、白粉病、小麦锈病。减轻玉米黑粉病、小斑病和大斑病。柑桔黄龙病，苹果腐烂病等。关于钾能增强作物抗病虫害的原因可以从作物的组织特征和生物化学二方面来说明。钾能增强细胞表皮厚度，促进细胞木质化，能改善细胞的组织结构，增强作物抗病虫害的能力。由于钾能促进氨基酸的转化，有利于蛋白质的合成，从而减少氨基酸的积累，所以它能减轻病菌感染。
此外，合理的施肥还能防治作物缺素症，水稻缺钾叶片常发生褐斑病，棉花缺硼表现“蕾而不花”症，油菜缺硼表现“花而不实”症，玉米缺锌表现为“白芽病”，水稻缺锌的“矮缩病”等。合理施肥不仅能减轻病理性病害，还能防治生理性病害。合理施肥是一门科学，科学合理的施肥，不仅能够提高农作物的产量，而且可以增强农作物的抗逆性，有效减少病虫害发生，减少施用农药，实现高产高效的生态农业生产。
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