黄瓜嫁接技术在我国已经被普遍应用，用黑籽南瓜作砧木嫁接黄瓜，能够有效地控制枯萎病的发生与危害，并且可增强黄瓜的生长势。但在嫁接黄瓜生长期也出现了萎蔫逐渐致死现象。对病株进行分离鉴定，分析认为几种原因综合为：病原菌、线虫及生理原因所致。致病菌有镰刀菌、腐霉菌、细菌等。
一、病原真菌引起的萎蔫。植株表现为中午萎蔫，早晚恢复，反复数日后整株死亡。嫁接的接口以上部分、病茎的维管束无褐变现象。茎基处无缢缩，病株的侧根剥开根皮维管束褐变，严重的根系已经坏死，侧根分离出镰刀菌，进一步鉴定为尖镰孢菌黄瓜专化型和瓜果腐霉。回接试验表明，两种病原菌均可致使嫁接黄瓜萎蔫死亡。
二、细菌性萎蔫。发病初期叶片出现暗绿色水浸状萎蔫，不久全株死亡，手挤维管束的横切面有白色菌脓，导管不变色。有报道，在辽宁省的几个地区发现嫁接黄瓜栽培过程出现了细菌性萎蔫病，致病原为Evwiniatracheiphila.，该病害可能对我国嫁接黄瓜栽培存在着潜在危害。在天津地区的病株分离中未检测到。
三、根结线虫病引起植株萎蔫。黄瓜根结线虫病主要是由南方根结线虫（Meloidogyneincognita）侵染。根结线虫在土壤中以二龄幼虫侵染黄瓜新根的根冠，不侵染或少侵染老根。黄瓜根系被害后常诱发土壤中一些病原菌如镰刀菌等的侵染，加速根系腐烂，使植株提早枯死。根系被损坏后，影响正常的吸收，地上部生长受阻。症状轻的根结不明显，严重的生长缓慢，植株比较矮小，结瓜小而少，中午气温高，蒸腾作用强烈，水分和养分的输导受阻而呈萎蔫状态，浇水充足或早晚气温较低可恢复正常，反复发生几次，植株逐渐枯死。
四、嫁接技术引起的生理性萎蔫。黄瓜的维管束无褐变症状，根瓜膨大期植株表现出类似枯萎病的症状。进行病原分离未检测出致病菌，解剖接口的横切面可知是嫁接技术问题，苗期嫁接时切口太浅，砧木与接穗的维管束未完全对齐，导致肥水供应不足，致使植株反复萎蔫数日而死亡；另外一种原因是砧木与接穗的亲和性不高或不亲和，在苗期不明显，采收期对肥水要求较高时显症。
五、栽培管理不当引起的萎蔫。黄瓜嫁接后，接口离地面很近，大水漫灌很容易将接口长时间浸泡，造成伤口，引起土传病菌的侵染，或者致使根部窒息，在嫌气状态下土壤产生有毒物质，使根部中毒导致萎蔫，接穗产生气生根伸入土壤失去嫁接意义感病而死。
综述以上几方面的因素，引起嫁接黄瓜枯死可能是几种原因同时存在，也可能只是由一种或两种原因引起。防治上应以预防为主，移植前进行土壤消毒，降低土壤内的病菌及线虫基数；栽培措施上实行轮作倒茬，或者定植时覆盖地膜，防止大水漫灌；选择合适的嫁接砧木及嫁接时期；化学防治，发病初期绿亨一号可湿性粉剂3000倍液灌根，或者用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂与50%福美双可湿性粉剂混合灌根，每株用药液0.3-0.4kg。细菌性萎蔫病用72%农用链霉素可湿性粉剂4000倍液，或新植霉素150-200mg/L、50%DT可湿性粉剂500倍液、77%可杀得可湿性粉剂400倍液。
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