肥料是药用植物生长不可缺少的重要物质，它对促进其生长发育、提高产量和质量起着主要的作用，但必须注意合理施肥，不能按传统或沿用其他农作物的施肥方法进行套用或滥施。现根据中药材规范化生产（GAP）的有关规定，归纳以下几点，供广大药农在生产时参考。
一、根据中药材的品种特性而施肥
一般对于多年生的、特别是根类和地下茎类药用植物，如芍药、大黄、党参、牛膝、牡丹等，最好施用充分腐熟好的有机肥为主，增施磷、钾肥，配合使用化肥，以满足一个生产周期对肥料的需要。一般全草类中草药可适当增施氮肥；花、果实、种子类的中药材则应多施磷、钾肥。在中药材不同的生育阶段施肥也应有所不同。一般是生育前期，多施氮肥，施用量要少，浓度要低；生长中期，用量和浓度应适当增加；生育后期，多用磷、钾肥，以促进果实早熟，种子饱满。
二、根据土壤特性而施肥
（1）沙质土壤，要重视有机肥如厩肥、堆肥、绿肥、土杂肥等的施用，掺加粘土，增厚土层，增强其保水保肥能力。追肥应少量多次施用，避免一次施用过多而流失。（2）粘质土壤，应多施有机肥料，结合加沙子，施炉灰渣类，以疏松土壤，创造透水通气条件，并将速效性肥料作种肥和早期追肥，以利提苗发棵。（3）壤质土壤，此类土壤兼有沙土、粘土的优点，是多数中药材栽培最理想的土壤，施肥以有机肥和无机肥相结合，根据栽培品种的各生长阶段需求合理地施用。
三、根据天气而施肥
在低肥、干燥的季节和地区，最好施用腐熟的有机肥料，以提高地温和保墒能力，而且肥料要早施、深施，以充分发挥肥效。化学氮肥、磷肥和腐熟的农家肥一起作基肥、种肥和追肥施用，有利于幼苗早发，生长健壮。而在高温、多雨季节和地区，肥料分解快，植物吸收能力强，故不易施得过早，追肥应量少次多，以减少养分流失。
四、施肥原则
（1）以氮肥为主，磷钾肥配合施用。（2）以基肥为主配合施用追肥和种肥。（3）以农家肥为主，农化肥配合施用。在施用农家肥的基础上，施用化肥，能够取两种肥之长补短，缓急相济，不断提高土壤供肥能力。同时能提高化学肥料的利用率，克服单纯施用化肥的副作用，以提高中药材的质量。
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