水蛭的生存能力与抗病能力相当强，只要按照科学的饲养方法去操作，在饲养过程中极少发生病害，但是如果饲养管理不当，也会造成水蛭疾病。引起水蛭发病的主要原因有以下几个方面。
水蛭的养殖密度，一般和外界温度有关。温度低时，密度可适当大些；温度高时，密度可适当小些。而在实际养殖时，春季温度偏低，密度应该大些，而由于是放种期，又不可能太大。
夏季温度偏高，养殖密度应当小二些，而由于水蛭大量繁殖，又显得养殖水体不足。如果放养密度高于正常密度3 倍以上，必然造成水蛭活动空间相对减小，再加上饵料不足或分配不均，排泄物过多，有可能发生互相残杀，或引起疾病的发生和蔓延。
温度不稳定是指气温过低或昼夜温差较大等，这样都会使水蛭的抗病能力下降，造成水蛭不适应或患病。寒冷时未及时采取保护措施，如在倒春寒季节受冻，就会引起水蛭发病或死亡；炎热时未采取降温防暑措施，如水温过高，太阳直接照射等，都会造成水蛭食欲减退，甚至死亡。
造成营养不良的原因：一是养殖密度过大，饵料分配不均，使弱者更弱，而逐渐消瘦， 装取料机体质下降，感染疾病或死亡；异是饵料营养配比不合理，长期饲喂单一饵料，造成营养不良，抵抗能力下降；三是投饵不遵循“四定”的原则，水蛭时饥时饱，有时吃了腐败变质的食物，也会造成发病或死亡。
随着小水蛭逐渐长大，池中的排泄物不断增多，再加上残饵大量存积和气温的升高，或长期处在高温季节，如果不及时换水，池水就会腐败，严重时发黑发臭，有害病菌大量繁殖，极可能引发各种传染性疾病。
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