引起辣椒果实病变的还有两种病害，一种是辣椒软腐病，另一种是辣椒真菌性黑斑病。与上述病害症状表现不同的是：辣椒软腐病多发在青果上。果皮最初呈水渍状暗绿色斑，后变褐软腐，具有恶臭味，有的果肉腐烂，果实似“一兜水”。
后期病果失水干缩，仅留白色果皮挂在枝蔓上。此病为细菌引致的病害，防治用药同上。还有一种真菌性黑斑病，也常在高温时发生，但果实上病斑最初为淡褐色、近圆形或不规则形，稍凹陷。病斑较大（10～20mm），后期病斑上会密生黑色霉层，即病原菌。该病的特点是多发生在果实日灼部。对该病的防治用药应选用50%腐霉利可湿性粉1000倍，64%恶霉灵可湿性粉500倍、75%百菌清500～600倍，40%克菌丹可湿性粉400倍。
防治方法：
1.种子处理播种前用种子重量0.3%的50%琥胶肥酸铜（DT）可湿性粉拌种。
2.农业防治实行轮作，与辣椒以外的十字花科作物轮作2～3年；辣椒应进行垄作，雨后及时排水；及时清除田间病残体，收获后深翻晒垡。
3.化学防治发病初期及时喷药。可选用50%琥胶肥酸铜（DT）1000倍液可湿性粉、14%络氨铜水剂300倍、77%氢氧化铜（可杀得）可湿性粉500倍、72%硫酸链霉素4000倍、58%甲霜灵锰锌可湿性粉500倍、60%琥·乙磷铝可湿性粉500倍，以上药剂任选一种，每7～10天一次，连续用2～3次，注意：采收前3天，应停止用药。
