在我省大部分地区棚室栽培中，黄瓜的污染主要自肥料中的硝酸盐和农药中的有害物质。如何减少黄瓜的污染，达到无公害标准，我们认为：关键是栽培中把好"三关"。
一、把好施肥关。黄瓜中的硝酸盐污染来自肥料，科学施肥是防止（减少）黄瓜污染的主要措施。底肥施用上采取有机肥与无机肥相结合的方法，以有机肥为主，有机肥必须充分腐熟，禁止施用生粪。化肥要采用平衡施肥，即按黄瓜适合的氮、磷、钾肥比例进行配方施肥，整个生育期禁止追施硝态氮，追肥以生物肥、有机肥为主，适量施用铵态氮肥。
二、把好播种前、定植前消毒关。黄瓜种子表面常附有炭疽病、细菌性角斑病、枯萎病等多种病原物，为防止病害随种子传播，播前进行种子消毒十分必要。最简便、经济、实用的方法是温汤浸种，方法是将种子在凉水中浸湿，再用50-55℃，10-15分钟后，把种子捞出放在冷水中，方法是将种子浸湿，再用40%福尔马啉100倍浸种15-20分钟，捞出种子用清水洗净。种子消毒也可以对具体的病害使用专用药剂，如疫病用甲霜灵浸种，病毒用磷酸三钠浸种等。多年种植蔬菜的土壤中也有多种、大量的病菌，在很大程度上决定发病的种类和程度，因此，土壤消毒也很必要。常用药剂有五氯硝基苯、多菌灵等，针对具体病害使用专用药效果更好。在连续种植蔬菜的棚室里，在棚架、墙体、植物残体、地表等残留病菌的部位，定植前彻底清除残枝落叶，然后用硫磺、敌敌畏熏蒸，每亩按硫磺2-3千克，DDV0.5千克，拌锯末，点燃熏蒸一昼夜，能够有效杀死虫源，减少病源基数。
3、把好生长期温湿度控制关。每一种病害的发生与传播，都与环境条件有密切关系，而病菌适宜的环境与蔬菜生长适宜的环境，一般情况下是存在着差别的。我们把病菌繁殖、侵染适宜的环境条件与蔬菜生长适宜的环境进行比较，利用植物与病菌所需适宜环境条件的差别进行生态防治。通过控制温湿度，对黄瓜霜霉病进行生态防治就是很成功的一例。黄瓜生长发育适温25-32℃，生物学温度为10℃，湿度70-90，而霜霉病发生的最适温15-24℃，湿度83%以上，叶片上有水滴或水膜。温度低于15℃，高于25℃，对霜霉病有明显的抑制作用。利用黄瓜生长发育与霜霉发生所要求的最适宜环境条件的明显差异，对黄瓜进行变温湿管理，可以实现黄瓜增产和减轻霜霉病的发生程度的效果。
在设施栽培中湿度是一个较难控制的因子，可以在设施内进行地膜覆盖，于膜下浇水，减少水分蒸发。黄瓜变湿管理中，傍晚放风降温排湿，对减小夜间湿度也有明显作用。
对黄瓜进行生态防治的结果是减轻发病，而不是不发病，因此必要时还需药剂防治。为了确保生产的黄瓜是无公害的放心蔬菜，必须做到科学用药，不使用在蔬菜上禁止使用的农药品种，使用允许使用的农药品种也要注意用量（浓度），以及安全间隔期等。
