通风库贮藏：通风库因贮藏前期温度偏高，中期又较低，一般只适宜贮晚熟苹果。入库时就分品种、分等级码垛堆放，堆码时，垛底要垫放枕木（或条石），垛底离地10～20厘米，在各层筐或几层纸箱间应用木板、竹篱笆等衬垫，垛顶距库顶50厘米以上，垛距门和通风口（道）1.5米以上，以利通风、防冻。贮藏前期，多利用夜间低温来通风降温。贮藏中期，减少通风，库内应在垛顶、四周适当覆盖，以免受冻。贮藏后期，需每天观测记录库内温度、湿度，并经常检查苹果质量。
冷库贮藏：苹果适宜冷藏，尤其对中熟品种最适合。贮藏时最好单品种分别单库贮藏。采后应在产地树下挑选、分级、装箱（筐），避免到库内分级、挑选，重新包装。入冷库前应在走廊（也称穿堂）散热预冷一夜再入库。码垛应注意留有空隙。一般库内可利用堆码面积70%左右，折算库内实用面积每平方米可堆码贮藏约1吨苹果。冷库贮藏管理主要也是加强温湿度调控；通过制冷系统经常供液、通风循环，调控库温上下幅度最好不超过1℃。冷库贮藏苹果，往往相对湿度偏低，所以，应注意及时人工喷水加湿，保持相对湿度在90%～95%。若想保持其色泽和硬度少变化，最好是利用聚氯乙烯透气薄膜袋来衬箱装果，并加防腐药物，有利于延迟后熟、保持鲜度、防止腐烂。
气调贮藏：苹果最适宜气调冷藏，尤以中熟品种金冠、红星、红玉等，控制后熟效果十分明显；气调库贮藏的苹果要求采后2～3天内完成入贮工作，并即时调节帐内气体成分，使氧降至5%以下，以降低其呼吸强度，控制其后熟过程。一般气调贮藏苹果，温度在0℃～1℃，相对湿度95%以上，调控氧在2%～4%、二氧化碳3%～5%。气调贮藏苹果应整库（帐）贮藏，整库（帐）出货，中间不便开库（帐）检查，一旦解除气调状态，即应尽快调运上市供应。
