苗床管理的目标是防徒长，防病害，减少非生长期，达到根多苗壮。主要措施有：
1、温度管理。播后到大部分种子出苗前，床内温度白天保持在25-30℃，夜间在16-18℃，床温要与气温相适应或略高出1-2℃。迫不得已时，可在床内放置葡萄糖瓶，热水袋等装入热水进行加温。80%的苗子出土后，温度宜开始放低。白天20-25℃，夜间14-16℃。分苗后的3-5天是缓苗期，温度宜高，白天30℃左右，夜间16-18℃缓苗后则转入正常的温度管理。但若按大温差育苗时，缓苗后白天气温控制在30-35℃，不超过38℃，夜间5-8℃，不低于5℃；阴天的白天20-23℃，夜间可比平日略高些。但育苗与生产结合进行时，苗床温度管理还应照顾到温室里生产作物温度需要。定植前要进行一次适应性炼苗，此间白天黑夜苗床上都可不再加盖覆盖物。苗子要搬到温室前沿，两墙根处，使其能适应定植后将可能遇到的新环境。
2、光照调节。增加光照对培育壮苗尤为重要。苗床覆盖小拱棚虽然对增温保温有较好的效果，但却减少了阳光透入苗床里的数量和质量。生产上常见到一些农户始终不敢揭开小拱棚上薄膜的错误做法，结果床内温度大、光照弱、苗子徒长幼嫩，病害亦重。特别是在遇有连阴天情况下，由于缺光，苗子饥寒交迫，极易死亡，为了增加苗床里的光照，可使用已用过1年的旧膜。使用新膜时最好对覆盖苗床的部分预选进行一下无滴化处理（如用豆面擦试）。除在出苗时，增加光照。但在连阴温度保不住时，白天可不揭开膜。
3、水分管理。水分管理有两方面的内容：一是苗床浇水；二是床内空气温度的控制。给苗床浇水常有两种倾向，一是控水过度，主要怕苗子徒长和染病。须知，一般苗子徒长并不完全是由于水分过多造成的。而要促进苗子稳长快长，水分是不可缺少的。黄瓜根系弱，土壤水分宜充足，一般要保持田间最大持水量的80%-90%。另一种倾向是浇水过度，床土经常保持泥泞状态。造成这一问题的原因首先是床土黏重，透水性差。其次是一些人不分析苗子不长或长得慢的原因，盲目地认为是缺水造成的。结果浇水越频繁，床土透性越差，床温越低，老根沤掉，新根不发，最终苗子还是不长。如果遇到连阴天低温，床土温度大常是造成沤根的主要原因。苗床空气湿度虽然也受到温室内空气湿度的影响。但主要是来自床土水分的蒸发和秧苗的蒸腾。揭开小拱棚放湿是不可缺少的，但主要应减少床土水分蒸发。减少土壤水分蒸发，还有减少浇水次数和提高床温的作用。床土水分过大时，可以搂划床土表面或顺沟撒些草木灰吸去一部分水分。另外，向床面均匀撒些过筛的细干土，即可给幼苗培土（稍有徒长的更需如此），诱导不定根发生，扩大根群，又要阻止床面水分蒸发，减少床内空气湿度。夜间把吸湿性好的草苫盖到塑膜里边也可吸收一部分水汽。
4、分苗。籽苗第一片真叶展开时，即可以考虑分苗了。分苗前要采取控水、降湿等炼苗措施，分苗时也必须选晴天的上午进行。移苗床的株行距一般为10厘米×10厘米，为了防止意外情况下苗子过大，有条件时可以将株行距扩大到12厘米×12厘米。分苗假植时要浇40-50℃热水，分苗后要盖严小拱棚，尽量提高温度并注意保持较高夜温，以利加速缓苗。心叶开始生长缓苗结束，即可转入正常的温度管理。
5、苗病防治。冬春茬黄瓜苗期病害比较严重，不仅有侵染性病害，还用生理病害。侵染性病害主要有猝倒病、炭疽病、黑星病等。这些病的发生都与苗床湿度大、温度低和床土带菌有关。在棚膜经常滴水的地方，常常容易出现猝倒病的发病中心，由此扩延，遍及全床。猝倒病有时会在连阴突晴，使秧苗暴露在强光下而大面积发生。苗床防病的首要条件是搞好种子消毒、床土消毒及苗床温度和水分管理。床土消毒主要用的农药有五代合剂和五福合剂。按每平方米苗床用五代或五福合剂8克，先用过筛细土1千克将药掺匀，再加入过筛细土14千克进一步拌匀即成药土，拌种前将苗床喷入温水，随即用2/3药土撒匀，然后划道点播，再用剩余1/3药土封盖苗床即可，这称“下铺上盖”。
出苗后，定期喷用敌克松、托布津、菜病畏、双效灵-Ⅱ等，也可有效地控制侵染性病害发生和蔓延。
