1、有机肥料的施用：烟草常用的有机肥料有：堆肥、厩肥、圈肥、绿肥、人畜尿粪、各类油脂的糟粕、腐殖肥以及土杂肥等。有机肥由于构成肥料的材料不同，即使同名的肥料，其有效养分的含量也千差万别。有机肥料中含有比土壤高得的分解、半分解与末分解的有机物质，含有烟草多种必需的大量与微量营养元素，是一种完全肥料，易被根系吸收。另外，各类油脂粕，在被微生物分解过程中，还产生一些类生长素、抗菌素等具有生理活性的物质，对于促进和保持根系的各种生理活性有良好的作用。有机肥料含有胶体类物质，多孔疏松，在改善和保持土壤良好物理性状方面有明显作用。由于有机肥料既含有一定数量的速效养分，又含有相当数量在土壤中逐步分解才释放出来的养分，具有较高的持续供肥能力。但施用过量时，容易造成供肥后劲过长、过大，使烟叶成熟期供氮水平过高，影响落黄成熟，尤其是土壤有机质含量高，土壤速效氮素释放迟的粘质土壤，要特别注意有机肥料施用不要过量。
在有机肥施用时，对掺混人畜粪尿的有机肥，不能施用过量，以免造成烟株吸氯过量而影响品质。烤烟施用的有机肥，除了强调要充分腐熟外，在土壤和地下水含氯量高的烟田，尽量避免掺入过多的含氯粪尿。有机肥主要是当做基肥施用，在春季耕翻和起垄时将全部有机肥一次性施完，也有少数地区做追肥施用。我国多数地区的烟田，分布在有机质含量低，土壤物理化学性状不良的贫瘠土地上，施用有机肥料，对于提高和稳定烤烟产量和品质具有重要作用。
2、化学肥料的使用：化学肥料的养分含量较有机肥高得多，肥效大。烤烟常用的单体氮肥中，尿素含量46％，硝酸铵含氮20％；磷肥中过磷酸钙，有效五氧化二磷含量12-18％不等，其中水溶性成分占总含量的80％左右，重过磷酸钙中含五氧化二磷36-52％；钾肥主要为硫酸钾，氧化钾含量50％左右。烤烟常用含二种和三种大量营养元素的肥料，称为复肥。如二元中的磷酸一铵和二铵，含氮16-18％，含五氧二磷46-53％；硝酸钾含有氮与钾，磷酸二氢钾含有磷与钾。三元复肥系由单体或二元肥料混合造粒，含氮磷钾三元素，其含量比例，可随各地需要配制。另外烤烟上还可施用多元肥料。多元肥料中，一类是含有氮磷钾镁大量元素和微量元素的复肥，另一种是含有多种微量元素的多元微肥。近年来，不少烟区，以饼肥粉碎后作“骨架”，与氮、磷、钾、微量元素化肥混合造粒，制成有机无机复肥，肥效甚佳。各种肥料的性质和使用见表。
化学肥料的使用要因地制宜合理使用，尽管时间、地点不同，具体措施各异，但在使用时要做到用量合理，不是越多越好；化学肥料与有机肥料配合使用，有利于增加联庆效果；要正确搭配氮磷钾用量和微量元素的用量；要科学的土壤管理的灌溉，施肥后加强土壤的保墒、保肥、保温性能和通透性，做到及时灌溉、松土等。3、施肥量的确定：在目前烟草的生产水平下，确定适宜施肥量应以保证获得最佳品质和适宜产量为标准，根据确定的适宜产量指标所吸收的养分数量，再依据烟田肥力的情况等，来设计施肥方案。烤烟适宜施肥量，最重要的是氮数量来确定。正确地确定氮素用量，要根据使用的栽培品种、土壤肥力状况、肥料种类和土壤与肥料中氮素的利用率来确定。目前确定施氮数量的方法大多数用测土施肥法和经验施肥法。
不同类型的烤烟及不同品种，叶片中最佳品质的含氮量不同。一般高烟碱型烟叶片，最佳含氮量为1.8-2%，而低烟碱性烤烟叶片为1.5％左右。在正常情况下，高烟碱型烤烟150千克/亩左右产量时，叶片含氮量占全株50-55％，低烟碱性烤烟占45-50％。烟株吸收土壤有效氮素的量，一般由土壤有效氮含量千克/亩乘以土壤有效氮素的吸收利用率。
测土施肥：就是测定土壤的有效氮数量，来求出烤烟从土壤中吸收的氮量。这个量与预定产量时吸氮总量的差数，就是烤烟应从肥料吸收的氮量，再除以所施氮肥的吸收利用率，就得到了应施用的氮肥数量。土壤有效氮素与肥料中氮素的利用率，因不同肥力与质地的土壤，不同栽培品种，年度间降水量与降水分布不同，而有较大的变化。目前最好的方法是用同位素N15标记法，可准确地求得土壤中有效氮与肥料中氮素的利用率。近年研究认为，0-60厘米土层含有有效氮的含量与烤烟产量有较高的相关性。
经验施氮量：选择产区内当地植烟代表性土地，将土壤性状相同的土地，按肥力划分为高低几个等级，每个等级的烟田，以获得产量品质双优田块的施氮量为准，参照该地前茬产量、施肥情况、当年降雨状况，提出下年度各肥力等级土地，各种情况下的适宜施氮量标准。这种方法是建立在取得当地情况下烟叶优质适产实际结果田块的基础上，因此有较强的实用性与可靠性。
磷、钾肥的施用量：通常是在施氮量确定后，以氮量为基础，按照当地烟田土壤中有效钾、磷的含量状况，确定氮、磷、钾的比例，推算出磷、钾的用量。由于烤烟对磷的吸收仅为氮量的二分之一～三分之一，而常用的磷肥吸收利用率较低，所以生产上的施用量往往与氮量相当或稍多一些。烤烟对钾素的吸收量约为氮量的1.5-2倍。施肥时，在有效钾含量不同的土壤上，氮、钾比有较大不同。土壤中有效钾含量高，在烟草生育期钾素淋失轻的土壤，施肥中氮钾比1：1即可，反之，则要高至1：4。
4、施肥方法：烤烟的施肥方法可分两种：一是土壤施肥将肥料施入土壤，由根系进行吸收。二是根外施肥，也叫做叶面施肥，将营养元素溶解在水中，喷洒到叶面，由叶面进行吸收。
土壤施肥：主要包括各种肥料基、追肥的用量比例、施用时间、施肥位置。一般认为施肥的总量主要是施氮量，能够控制烤烟吸收量的多少，从而控制产量水平。只有通过基追肥合理分配及施用时期与位置的巧妙安排，才能达到调节烤烟生育前、中、后期养分供应水平，从而获得优质适产。
我国烤烟施用的肥料中，有机肥料与磷钾肥，大部分地区作基肥施用。只有南方多雨地区，用腐熟的人畜粪尿，兑水作追肥浇施。氮素化肥和复合化肥，在北方烟区以3比2作基肥，南方以2比1作基肥。基肥的施用时期，有的地方在栽前7-30天，结合整地起垄，埋入垄内。有的地方在移栽时或栽后立即施用。追肥的施用时期，除南方多雨地区外，一般都在烟株团棵前，大约在栽后25～30天内追施完毕。多雨地区，由于肥料流失较多，追肥的次数要多，甚至打顶时还要追施一遍开顶肥，追肥占总施肥量的比例也大，氮肥追施的量眼过基肥用量。
基追肥的施用位置应根据氮、磷、钾、有效养分的形态和在土壤中的移动特点来确定。一般施肥的深度以10-15厘米左右为宜。在保肥力差的沙质土，亦不浅于5厘米。较干旱的地区，施肥深度以15-20厘米为宜。
烤烟的基肥，无论是有机肥还是无机肥，都是采用集中施肥法。一种为条施，起垄时成条状埋入土中，另一种是集中施于栽植穴内。各地采用哪种方法适宜，要根据土地状况，肥料量的多少及移栽后降雨分布状况而定。一般肥力较高的土壤，采用窝施的方法比较适宜。土层薄、土壤肥力低的田块，采用条施的方法比较适宜。
根外追肥具有对养分吸收速率高，烟株吸收得快，吸收利用率也高，叶面吸收的养分能迅速运转至烟株其它部位等特点。
目前叶面营养剂种类很多，施用时要根据烟田中烟株的长相，表现出缺乏哪些养分，选用含有相应养分的叶面营养剂。可以直接喷哂所缺元素的水溶液，但注意喷洒的剂量，以免过量施用造成毒害。
叶面营养剂的施用方法，主要采用喷雾法，雾点越细效果越好。喷洒时，营养剂溶液的总浓度以不超过1％为安全，空气干燥时，还应降低浓度以防烧伤叶片。喷洒的时间，以下午近傍晚时为佳。喷洒时将喷头向上，喷洒在叶背面，效果更好。叶面营养剂可以和普通的杀虫剂农药混合施用，以节省人工。
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