在一些蔬菜种植区，由于大棚内连年种植同一种蔬菜，大量施用化肥，造成猝倒病、立枯病、根腐病、枯萎病、灰霉病、青枯病等土传病害越来越严重。
防治土传病害要以“预防为主、综合防治”为方针，充分利用设施栽培的优势，改善栽培条件，营造不利于土传病害病原菌生存和侵染的环境，并结合科学、合理、安全、有效的药剂防治，有效抑制和减轻土传病害的发生和危害。
一、严格实行轮作
实践证明，轮作是防治土传病害最经济有效的措施。茄科、葫芦科作物与十字花科或豆科作物实施轮作，效果较明显；十字花科作物与葱、韭、蒜类蔬菜轮作，效果也较显著。
二、土壤消毒
棚地翻耕、整畦前或移栽秧苗前进行土壤消毒，可每亩用50%多菌灵可湿性粉剂2.5-3公斤，撒施于土表后翻耕、做畦。也可每平方米用立枯净、立枯宁、敌克松、甲基托布津可湿性粉剂2-3克撒施或喷雾。
三、苗床消毒
9-12月正值茄子、黄瓜等蔬菜的育苗期，此时要配好苗床土。将60%的菜园土(上年不种同科作物的菜园土)、35%充分腐熟的有机肥、4%的木屑、0.5%的多菌灵和0.5%的复合肥，充分混合均匀后，密封10-15天即可使用。将苗床土的65%铺于苗床底层，厚4-5厘米，铺平后用30%瑞苗清水剂8毫升对水16公斤淋洒苗床8-10平方米，施药后2-3小时播种，播后将剩下的35%的苗床土盖于苗床表层，厚1.5-2厘米，然后用多菌灵可湿性粉剂500倍液喷淋苗床。这样可有效预防苗期猝倒病和立枯病，同时可预防枯萎病、黄萎病、茎基腐病、根腐病等病原菌的侵入。
四、深翻土壤
将大棚内土壤深翻25厘米左右，然后暴晒3-5天，以风化土壤、高温杀菌、改善土壤环境，使蔬菜根深叶茂，增强抗病能力。
五、深沟高畦栽培
最好进行深沟高畦栽培，沟深15-20厘米、沟宽30厘米，畦面做成龟背形，这样田间不会积水，有利于进行沟灌、滴灌和喷灌。
六、适当施用生石灰
因大部分土传病害的病原菌有喜酸性土壤的习性，因此可结合翻耕土壤，每亩撒施生石灰50-75公斤于土壤耕作层，调节土壤酸碱度为6.5-7，形成不利于青枯病、枯萎病、黄萎病、软腐病和根腐病病原菌生存和繁衍的土壤环境。
七、药物防治
必须严格实行“无病先防、预防在先”的方针。土传病害的防治，不宜采用叶面喷雾法，而应采取灌根法。在未发病前或发病初期，用瑞苗清水剂2000-2500倍液灌根，每株灌浇药液100-150毫升，每隔7-10天灌1次，连灌3-4次。用40%根腐灵可湿性粉剂600-800倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或72%农用硫酸链霉素3500-4000倍液交替灌根，可有效防治多种土传病害。
