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1、物理防治：巢虫是蜡螟的幼虫，蜡螟有趋光性，因此可利用黑光灯诱杀蜡螟，具体操作时黑光灯要设计成内外两层，外层孔格比蜜蜂小以防蜜蜂扑灯，内层接入电源用于杀死蜡螟。
2、药物防治：巢虫危害严重时可以采用药物防治，例如可用二硫化碳、甲酸、二氧化硫等熏闷巢脾和蜂箱，也可在蜂箱内部悬挂巢虫清木片，还可向受害巢脾喷洒康宽巢虫净等药物。
3、生物防治：巢虫在自然界中有很多的天敌，例如球孢白僵菌、苏云金芽孢杆菌、核型多角体病毒等微生物，蜡螟绒茧蜂、麦蛾绒茧蜂、蜡螟大腿小蜂等寄生性蜂类都是巢虫的天敌。
综上所述，巢虫是中蜂最常见的害虫，防治巢虫主要有物理防治、药物防治、生物防治等方式，其中物理防治是指用黑光灯诱杀蜡螟，药物防治是指用二硫化碳等熏闷、悬挂巢虫清木片或喷洒巢虫净等药物，而生物防治则是利用蜡螟绒茧蜂等天敌防治巢虫。
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