对虾肠肝胞虫是一种感染虾类肝胰腺及肠道的微孢子虫，该虫2009年首次在泰国被发现，对虾感染后不会导致死亡，但出现严重的生长缓慢现象，导致对虾养殖产量下降。2015年，该病在江苏省如东、射阳、阜宁等地发病十分严重，南美白对虾养殖产量下滑明显。
对虾肠肝胞虫大小为0.7-1.1um，主要感染对虾的肝胰腺，在肝胰腺细胞内形成胞原质，成熟后通过对虾消化道散排出体外，在外界水环境中形成孢子体，这些孢子体散在于水体中并附着于藻类、碎屑或颗粒饲料的表面，以及池壁和底泥环境中。肠肝胞虫的孢子壁较厚，可达到10nm左右，一般药物难进入虫体内，因此传统杀虫药物对肠肝胞虫基本无效。
已有的研究表明，对虾肠肝胞虫的传播途径有两种。一种是垂直传播，即通过亲本传播给子代；第二种是水平传播，即通过虾虾传播，或虾经口摄食环境中的孢子体而感染。
对虾肠肝胞虫个体较小，很难通过常规光学显微镜进行诊断，可以通过组织病理或细胞病理学方法进行诊断，但方法繁琐，耗时长，费用高。目前对对虾肠肝胞虫的快速检测主要是通过分子生物学手段，其中包括套式PCR法、LAMP法等。
亚州水产养殖协会分别于2014以及2015年的虾类会议上针对该病进行了广泛的研究和探讨，对该病的流行病学特点、病理学、病原生物学以及检测方法达成了共识。2015年5月在第七届中国对虾产业研讨会上，国内对虾行业的专家学者也指出，对虾肠肝胞虫已成为我国对虾产业的严重的疾病种类。
为了更好地规范南美白对虾养殖，保证南美白对虾养殖苗种的质量，南通市质量技术监督局于2015年12月发布了地方标准《凡纳滨对虾（南美白对虾）健康苗种》，规定了南美白对虾健康苗种的质量要求，其中包括了肠肝胞虫、白斑综合征病毒等6种常见病原不得检出，明确了对虾肠肝胞虫的检测方法，为如东县南美白对虾苗种产业的健康发展提供了科学的技术依据。
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