1．性腺发育与成熟：三疣梭子蟹卵巢左右各一对，自体中央部分别向后延伸，覆盖其他脏器，并深埋于头胸甲前部的腔部。其发育可分为以下六期，即：
Ⅰ期：幼蟹交尾之前，腹部呈三角形，卵巢未发育。
Ⅱ期：已交尾卵巢开始发育，呈乳白色细带状。
Ⅲ期：卵巢呈淡黄或橘黄色，带状。
Ⅳ期：卵巢发达，橘红色，扩展到头胸甲的两侧。
Ⅴ期：卵巢发达，橘红色，卵产出后于腹部抱卵。
Ⅵ期：卵巢退化，腹部抱卵。
据研究，根据卵巢对体重的重量比的季节变化来推测，在濑户内海的三疣梭子蟹，其卵巢大约在10月开始发育。此时期的性腺指数3％多一些，到11月中旬则达到5％。冬季将继续发育，3月中旬为11％，至五月上旬进入产卵期时达14％，临产前超过15％。产2～3次卵的雌蟹，在每次产卵之后，可以看到卵巢迅速发育的现象。
2．交尾：三疣梭子蟹经第12或13次蜕壳便可达性成熟，这时的蜕壳称之为“成熟蜕壳”。经成熟蜕壳后，可进行交尾。天然海区最小型雌蟹甲壳宽13厘米，体重约230克，人工养殖个体至12厘米可进行交尾。
交尾季节随地区以及个体的年龄而有不同。当年5月至6月生的仔蟹在9月中旬至10月下旬为交尾盛期，7月的仔蟹到翌年春季为交尾盛期。
在进行交尾活动时，雄蟹在雌蟹未蜕壳前，追逐有时长达10天，一般持续2～5天，一旦雌蟹蜕壳即进行交尾。待雌蟹刚蜕完壳，身体处于柔软状态，雄蟹就附于其上，用第3、4对步足将雌蟹抱住，此时雌蟹背部向下，步足收拢，腹部张开，雄蟹用交接器将精荚纳入雌蟹贮精囊内，整个交尾过程约需2小时到半天。交尾活动一般只一次，但也有经过两次才告终的。贮精囊内的精荚刚开始呈桃红色，随着雌蟹甲壳硬化，精荚逐渐硬化、缩小、褪色，最后在雌蟹贮精囊内部分只能看到白色隆起。精子在贮精囊内一直贮存到翌年春季再行受精作用（精子在贮精囊内保存6～10个月仍有受精作用）。
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