当水面蓝藻不超过三分之一时，使用芽孢原粉可效抑制蓝藻，防病调水，一举多得，且成本低廉。
蓝藻，是一个老生常谈的对象，很多研究者和生产一线工作者都对其进行了大量的研究，得出了许多有效的治理方法。但是每年仍有许多养殖者在生产实践中，不能够及时的进行治理。
蓝藻不是一种藻，是一个门，它包括蓝球藻、颤藻、念珠藻和发菜，主要进营养生殖。蓝藻并不是都有害，如蓝藻中的发菜和普通念珠藻可以作为食品；鱼腥藻可以固定大气中的氮，从而提高土壤肥力；有些蓝藻还是鲢鳙的食物。在水产养殖上，蓝藻的危害主要是形成蓝藻水华和释放藻毒素。
一、蓝藻爆发的危害
蓝藻的细胞比细菌大，但蓝藻是单细胞生物，所以我们用肉眼是分辨不清蓝藻细胞的，当蓝藻以细胞群形式出现形成“水华”时，我们才能发现它。在一些营养丰富的水体中，有些蓝藻常于夏季大量繁殖，并在水面形成一层蓝绿而有腥臭味的浮沫，称为"水华"，大规模的蓝藻爆发，被称为"绿潮"。绿潮引起水质恶化，严重时耗尽水中氧气而造成鱼类的死亡；发生蓝藻水华的水体pH值一般比较高，像在晴天下午都会达到9以上，影响养殖品种。
蓝藻毒素通过其危害方式可分为肝毒素和神经毒素，它们是已知的会侵袭肝脏和神经的毒素，另一类毒素对皮肤有刺激作用。蓝藻中个别种活体带毒，如蓝藻中的项圈藻可快速产生致死因子，破坏养殖对象的鳃组织，干扰其新陈代谢的正常进行，麻痹神经，使其死亡；大部分蓝藻死亡个体也会分解产生蓝藻毒素(如微囊藻毒素)。蓝藻毒素量多时可直接造成养殖对象中毒死亡；或者即使数量少，也可通过食物链积累效应危害养殖对象，直至危害人体。
二、蓝藻爆发的原因
1、水体富营养化，氮磷比失衡。蓝藻自身具有固氮作用，因此水体中氮的含量对其生长影响不大，但是磷却是来源水体，因此，富营养化的水体中，含磷丰富的蓝藻生长更快。
2、温度和水体流动性。受其它藻种的生长制约，蓝藻并不可能在常温条件下大规模暴发，水温25-35℃时，随着投饵的增加、投入营养元素的增加，蓝藻的生长速度才会比其他藻类快；流动性的水体中蓝藻爆发的概率远远小于静水水体，如黄河和太湖相比，太湖发生蓝藻的机会更大。
3、日常管理。正常水体中，都存在蓝藻藻种，就跟人体具有癌细胞一样。在日常管理中，如果养殖者引入外源水后，没有及时注意塘内的藻相及浮游动物的变化，那么浮游动物快速生长摄食其他藻类使藻相失衡后，水体中藻类又没有得到及时补充的情况下，蓝藻就会大量爆发。
三、防治办法
1、对于蓝藻，坚持防大于治，一定要做好蓝藻预防工作。
1）每个养殖池塘，一定要套养一定数量的200g以上的花白鲢；
2）使用微生态制剂如芽孢杆菌、EM菌，及时分解有机质，管理好水质；
3）使用优球藻加氨基酸肥水膏，让水体保持一定的肥度，维持良好的藻相；
4）控制水体中的浮游动物，防治水体藻类单一化；
5）有换水条件的可以定期换水；没有换水条件的，要多开增氧机，增加水体的流动性。
2、治疗。
1）使用蓝藻分解酶、蓝藻速灭，搭配碧水解毒安，下风口局部用药，同时加开增氧机；
2）及时改底，可用解毒底加氧搭配分解底爽，分解沉降在池底的死藻和有毒有害物质；
3）肥水培藻，可用优球藻或藻种源搭配氨基酸肥水膏定向培藻，加快培育绿藻和硅藻等有益藻类快速生长。
