由于生活在水环境中，水生生物生病往往不如陆生动物生病时那样容易被发现，一般在发现时鱼类已部分死亡。给药方法也不如治疗陆生动物那么容易，患病个体大多失去食欲，口服仅限于尚未失去食欲的群体；对养殖水体给药，如全池泼洒，只适用小面积水体，大面积池塘，用量大，成本高，也不便操作,而且，治病药物多数具有一定毒性，有的药物还会在池水中或动物体内残留，因此，一定要树立防重于治的观点。
由病原生物引起的疾病，是病原，宿主和环境条件三者相互影响的结果，那么，疾病的预防就可以从这三方面下手：
病原----控制和消灭病原体
1、使用无病原污染的水源
水及其水系统是水产养殖动物疾病病原传入和扩散的第一途径。在建造养殖场前，应对水源进行周密考察，建立蓄水池，这样可以先将养殖用水引入蓄水池自行净化，进行沉淀或消毒处理后再灌入养殖池中，就能防止病原从水源中带入。
2、池塘彻底清淤消毒
池塘也是各种病原生物潜藏和繁殖的地方，池塘环境清洁与否，直接影响到养殖动物的生长和健康；因此，池塘清淤是预防疾病和减少流行病暴发的重要环节。
3、强化疾病检疫
必须遵守《中华人民共和国动物防疫法》，做好对养殖动物输入和输出的检疫工作。
4、建立隔离制度
养殖动物一旦发病，不论是哪种疫病，都首先采取隔离措施，以防疫病传播，蔓延而殃及四邻。
5、实施消毒措施
主要是对苗种，养殖工具，饲料及食场进行消毒。
宿主----增强养殖群体抗病力
1、培育和放养健壮苗种
放养的种苗应体色正常，健壮活泼，必要时先用显微镜检查，确保鱼苗不带有危害严重的病原。
2、免疫接种
免疫接种是控制水产养殖动物暴发性流行病的有效方法，这些年来，已陆续有一些疫苗应用于预防鱼类的重要流行病。
3、选育抗病力强的种苗
办法之一是从生病池塘中选择始终未受感染或已被感染但很快又痊愈的个体，进行培养并作为繁殖用的亲体。
4、降低应激反应
如果应激源过于强烈，养殖动物会因为能量消耗过大，使机体抵抗力下降。因此，养殖过程中应创造条件减少应激。
5、加强日常管理，谨慎操作
6、饲料应质优，量适
环境----改善和优化养殖环境
1、合理放养
包括两方面，一是密度要合理，二是混养的不同种类的搭配要合理。
2、科学用水和管水
通过对水质各参数的监测，了解其动态变化，及时进行调节，纠正那些不利于水生动物生长和健康的各种因素。主要水质参数有pH，溶解氧，盐度，温度，氨氮，硫化氢，透明度等。
3、适时适量使用水环境改良剂
能够改善和优化养殖水环境，并有促进养殖动物正常生长和发育的一些物质，称为水环境改良剂。常用的有生石灰，沸石，过氧化钙，光合细菌等。
