池塘中本来就有一些适应这个池塘条件的微生物，也就是池塘的土著生物菌群，这些微生物就是池塘水质净化的主力军。出于各种目的，水产养殖免不了会人为的往池塘里投加菌，甚至有几天不放一点菌就缺了点什么一样的习惯。
菌到了池塘水体里会怎么样？养殖户可以往池塘里投加菌，那池塘本身有没有对这些外来生物进行选择的权利？或者这些菌会不会在池塘中适者生存的自然淘汰？还是这些加进池塘的菌就会轻而易举的成为池塘优势菌，如愿的主导了这个池塘的水代谢？
看看微生物到了不同条件的池塘会怎么样？
一、池塘底部有适量的营养有机物、外水源质量可以的情况
1、池塘里微生物会多元化，优势的好氧菌和厌氧菌和平共处、乐也融融！
2、养殖密度比较低、投料量不大，池塘中的微生物会完全的承担起这个池塘水体的净化作用。
二、池塘底部有稍多的营养有机物、外水源质量偏肥的情况下
1、通过控料、控产量或者合理混养，可以达到省料、提高经济效益、水体生态平衡的目的。
2、为了提高产量，通过泼洒微生物，强化池塘的自净能力同时提高池塘的生产力，达到省料、提高经济效益、水体生态平衡的目的。
这时池塘如果配备有足够的增氧机等措施，一般溶解氧补充速度还是会高于微生物代谢所消耗的耗氧量速度，所以这种条件下人为泼洒微生物，一般池塘水体中的微生物依然会是以好氧微生物为主，池塘的水质依然会进行着良性的氮循环。
三、池塘底部积淤多、外水源质量富营养化的情况下
1、积淤太多和水体富营养化的池塘，其总耗氧量会太高，溶解氧的补充速度低于微生物代谢所消耗的耗氧量速度，水体尤其底泥部分的溶解氧会偏低，导致厌氧菌会被这个条件的池塘选择性占优微生物，氮循环进入了不良阶段。
2、池塘水体的溶解氧偏低，厌氧菌占优会怎么样？
池塘水体的溶解氧偏低，厌氧菌占优，同时好氧菌会渐渐地失去优势群的生存基础，池塘进入了厌氧代谢为主，厌氧代谢产物的堆积就影响了水质，严重时就出现了水质恶化。
3、池塘水体的溶解氧偏低，人为添加有益的好氧菌会不会就改变了水体的菌相（也就是优势菌群）？
不同的微生物有不同的生存环境要求，也就是说：池塘的理化条件才是水体优势菌群的决定因素而不是取决于你加的是什么菌。
4、池塘持续的富营养化同时滥用微生物的后果是什么？
池塘持续的富营养化同时滥用微生物会导致了次级的净化生物出现了，也就是说纤毛虫等以菌体等腐败物为生的生物就开始大量繁殖了。反过来说：出现纤毛虫等寄生虫的原因是：你的池塘富营养化了，杀虫先降低富营养化程度，否则虫子会杀之不绝！
四、池塘底部积淤多、外水源质量富营养化的情况下怎么办？
水体污染物的代谢、净化离不开微生物，同样的，水质恶化也是微生物造的孽。关键是在目前土池积淤比较严重、外水源比较富营养化、养殖密度要求比较高的条件下，如何扬长避短的发挥微生物的净化优势，避开微生物恶化水质的孽。
1、创造一个相对低富营养化的底部环境，降低底部耗氧量，让微生物相对顺利的进入有氧代谢。
降低底部富营养化程度
降低底部耗氧量
2、创造一个相对低富营养化的水体环境，降低水体耗氧量，让微生物相对顺利的进入有氧代谢。
3、把微生物固定在富氧的池水上层，让微生物在池塘最富氧的位置进行代谢，这一点在冬棚和室内对虾养殖中可能会有比较大的优势。
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