选株定植首先选好留种田地：以疏松肥沃、地力均匀的壤土或沙壤土为好，须排水良好，向阳温暖。当秋播的胡萝卜达到商品成熟后在田间进行株选，挑选叶色正、叶片少、不倒伏的植株，然后对其肉质根进行选择，要求表面光滑、色泽鲜艳，形状整齐不裂口、须根少的肉质根。把选好的肉质根再切去尾部数厘米，从中选择韧皮部厚、心柱较小、橙红色的肉质根，切去上部的叶子，留叶基部13厘米左右，然后把种株栽植在留种田中。种株定植时，要开沟，移入覆土，然后浇水，栽植距离因整枝的方法不同而异，如果只留一个主花枝采种，株行距可定为25×35厘米，如果准备摘心后留4~5个一级分枝采种的，可定为40×40厘米。
植株调整种株定植后，随气温上升，逐渐抽薹。一般主枝顶部首先产生花序，随后每一侧枝顶部又产生花序。至种株发育中期，侧枝再产生二次侧枝，其顶部再生花序，因此分枝繁多。通常主枝花序先开花，侧枝花序后开花，造成同一植株的花期以及种子成熟期延续时间较长，影响种子的采收。因此，为了让养分集中供应，使种子充实、饱满和成熟一致，生产上常对种株进行整株处理。方法有：单株整枝。即每枝留主枝上一个花序，这样主枝开花早，种子成熟早，籽粒大，但需要种株数较多。摘心整枝。即当薹高23~27厘米时进行主枝摘心，留强健的侧枝4~5条，每枝留一个花序，以后侧枝全部摘除。一般整枝。即留主枝和侧枝上4~5个花序，其余枝条或花序全部摘除。
适时采收当花盘变成黄褐色、外缘向内翻卷、其下部茎开始变黄时，即可采收种子。
