菜籽饼含有芥子苷，在芥子酶催化作用下可水解成有毒物质。菜籽饼的去毒方法为：
（1）将菜籽饼粉碎，然后加水煮沸或通入蒸汽，保持１００℃---１１０℃的温度处理ｌ小时，使芥子酶失去活性。使用此种方法时要注意加热时间不宜过久，以防降低蛋白质的饲用价值；并严格控制喂量，因为芥子苷仍存在于菜籽饼中，它可能受到其他来源的芥子酶以及肠道或饲料中的微生物所产生的酶的催化分解而继续产生有毒成分。
（2）由于芥子苷是水溶性的，因此，可用冷水或温水４０℃左右,浸泡２～４天，每天换水１次，这样可除去部分芥子苷。但此法养分流失很大。
（3）每１００份菜籽饼用浓氨水4.7－5份，或纯碱粉３.５份，用水稀释后，均匀喷洒到饼中，覆盖堆放３～５小时，然后置蒸笼中蒸４０－５０分钟；也可在阳光下晒干或炒干后贮备使用。
（4）选择向阳、干燥、地温较高的地方，挖一宽０.８米、深０.７～１米、长度按菜籽饼的数量来确定的１个坑。将菜籽饼粉碎并加水１千克饼加１千克水雪，浸透泡软后装入坑内，顶部和底部各铺一层草，上盖土２０厘米以上，２个月后可取出饲用。５
将菜籽饼与青饲料同时青贮后饲用；也可先干喂，喂后暂时不饮水。虽然进行了脱毒处理也要严格控制菜籽饼的喂量，以不超过日粮的１０％为宜。
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