对蔬菜病虫害进行农业防治可以降低病虫害的防治成本，省工、省时、减轻环境污染，提高产品质量。
清园一茬蔬菜收获后，很多附着在蔬菜残枝上的病菌散落在田间，进入土壤中，成为下茬蔬菜的污染源。因此菜农应在蔬菜生长后期加强病害防治，直接减少病原菌基数。并且在每茬蔬菜收获后，彻底清除田间残枝枯叶，对易感根系病害的蔬菜还要清除残根。
深耕深耕的目的是破坏病菌的生存环境，一般要求每次收获后深耕40厘米，借助自然条件，如低温、紫外线等，杀死一部分病菌。
消毒在蔬菜换茬间隙，深耕后灌足水，盖上塑料薄膜进行高温消毒，使土层10厘米处最高温度达70℃，能够杀死大量病菌，这是一种简单、有效的防控方法。
换土对一些较为固定、品种选择余地小而且投资大、效益高的蔬菜进行设施栽培，如日光温室，可采用去老土换新土的办法控制土传病害。换去耕层表土，用无毒表土补充。
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