细菌性肠炎主要危害草鱼、青鱼，在鲤鱼中也有少量发生。该病常与细菌性烂鳃病和赤皮病并发，且在草鱼养殖中更为明显，俗称草鱼三病。该病发病率与死亡率极高，一般死亡率可达50%，严重时可能会达到90%以上。细菌性肠炎一般流行于夏季，通常水温为18℃开始流行，水温25-30℃出现流行高峰。引起细菌性肠炎的病原为豚鼠气单胞菌（又称肠型点状气单胞菌、点状气单胞菌），为革兰氏阴性菌，端生短鞭毛，无芽孢。在PH6-12中均能生长，最适生长温度为25℃，在营养琼脂平板上菌落为圆形，能产生褐色色素，在R-S选择平板上作筛选性分离，典型菌落为黄色。
豚鼠气单胞菌为条件致病菌，该菌在正常水体、塘底淤泥以及健康鱼体肠道中正常存在。在水体良好，鱼体健壮时，少量该菌不会引起疾病，且其他器官中也未能发现该菌；当水温较高、水质恶化、鱼体抵抗力下降时，该菌在大肠内大量繁殖，随即发病。
病鱼常见离群独游、且游动缓慢，一般体色发黑并伴有食欲减退甚至完全不吃食。解剖发现症状早期肠壁局部充血，肠腔内完全没有食物或者仅仅肠道后端有少量食物，肠道粘液很多。后期症状为全部肠道呈现为红色，肠壁弹性差，肠内没有食物，有淡黄色脓液且肛门红肿。注意发病症状与草鱼出血病区别，草鱼出血病肠道弹性较好，肠腔内粘液较少；也需注意病症状与食物中毒病鱼的区别，食物中毒病鱼肠壁充血发炎，但是肠内有大量食物，大批死亡突然出现。而细菌性肠炎死亡个体逐渐增多直至突然爆发，且发病个体肠道内几乎没有食物。
加强池塘管理与水质管控是预防和控制本病的重要措施。豚鼠气单胞菌为条件致病菌，该菌在正常水体、塘底淤泥以及健康鱼体肠道中正常存在。养殖前的彻底清塘、该病流行季节水质管控、投食场周围的定期消毒等对于预防该病得发生至关重要。该病流行季节日常巡塘时应注意是否有病鱼或者死鱼，及时确认塘内鱼群是否潜在发病。近些年来主要的治疗措施是大蒜素混合抗菌类药物，一般为氟哌酸、环丙沙星等，再辅以生石灰全塘消毒，一般能取得很好的治疗效果。
