硝化细菌和EM菌在水产养殖中改良水质、降低氨氮、亚硝酸盐、分解有机物、提高水产动物免疫力等方面有突出的作用。但是任何一种菌种都有其自己的食性、生态位特点，这就要求我们必须找到其自我特点，用其所长，避其所短。
现将硝化细菌和EM菌的特点和区别列举如下，以使用户能更科学的使用这些活菌制剂。
Ø 解码硝化细菌和EM菌：
类别 | 硝化细菌 | EM菌 |
组成 | 亚硝化菌和硝化菌 | 有效微生物群的英文缩写，由光合细菌、乳酸菌、酵母菌、芽孢杆菌、醋酸菌、双歧杆菌、放线菌七大类微生物中的10属80种微生物共生共荣。 |
按营养需求分类 | 自养型微生物（完全在无机环境中生存，以CO2、碳酸盐为碳源，以铵盐和硝酸盐为氮源来合成细胞质的微生物） | 异养型微生物（以含碳有机物为碳源，含氮有机物或无机物为氮源，合成细胞物质） |
按溶氧需求分类 | 好氧性细菌 | 好氧性细菌、厌氧性细菌 |
生存条件 | 有氧的水中或砂层中 | 活菌在分存于水体中适合其生存的区域。如光合细菌分布于近光处，好氧菌分布于溶氧丰富区域。 |
突出作用 | 分解氨氮和亚硝酸盐 | 非常有效地分解有机物 |
繁殖速度 | 慢 | 非常快 |
平均代时(细菌繁殖一代所需时间) | 10小时 | 几十秒----几小时不等（组成微生物的不同菌种的有不同的繁殖速度） |
使用方法 | 外泼法----改良水质、减少病原微生物，减少发病率 | 外泼法----改良水质、减少病原微生物，减少发病率 拌饵内服----改善肠道菌群平衡、提高免疫力、降低发病率，明显提高增重率 |
Ø 硝化细菌和EM菌的不同水体使用效果对比
水体条件 | 硝化细菌使用效果 | EM菌使用效果 |
分解氨氮、亚硝酸盐 | √突出 □良好 □不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
分解有机物、粪便，去腥、除臭 | □突出 □良好 √不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
增加有益微生物数量 | □突出 √良好 □不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
减少病原微生物 | √突出 □良好 □不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
抑制蓝藻、裸藻等小型有害藻类 | □突出 √良好 □不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
分解大颗粒的杂质和藻类 | □突出 □良好 √不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
水质过于清瘦 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
增强鱼类的免疫力和抗病性 | □突出 √良好 □不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
促进生长，增重率明显提高 | □突出 √良好 □不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
弱碱性水体 | √突出 □良好 □不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
弱酸性水体 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
溶氧量不丰富或无增氧设施 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
稳定和改善水质 | □突出 √良好 □不佳 | √突出 □良好 □不佳 |
光照或光线充足 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 √良好 □不佳 |
含氯自来水 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 □良好 √不佳 |
3天内使用过消毒剂、杀虫剂、抗生素水体 | □突出 □良好 √不佳 | □突出 □良好 √不佳 |
Ø 硝化细菌和EM菌使用注意事项：
相同点：
1、 勿与药物同时使用：这两种菌都是活菌制剂，因此使用前、后3～5天内均不得使用杀菌剂、杀虫剂等药物，如使用需间隔3～5天。
2、 首次用量加倍：活菌制剂在第一次使用有个世代时间和区位竞争过程，首次用量加倍，以便迅速占领其固有的生态位。
3、 需要有“家”（基质或载体）：活菌繁殖必需要有一定的基质，如悬浮的颗粒、有机质等，但也不能过多。
4、 水温不适：细菌最适宜生长温度为20～30℃左右，水温过低或过高，均不利于生长繁殖。
5、 投放量不足：如大型生态鱼缸或者室外鱼池投放，投放量不足效果肯定不明显。
6、 贮藏：活菌制剂应置于阴凉、避光处存放，适宜温度为5℃－30℃，否则会降解细菌的活性，降低使用效果；产品开盖使用后应立即盖紧瓶盖，保持密封状态。
7、 水体注入含氯自来水时，应将含氯自来水放置一昼夜后加入活菌制剂。
不同点：
水体条件 | 硝化细菌 | EM菌 |
氧气 | 好氧菌，只有在氧气充足的条件下才能繁殖，否则根本谈不上高效率地处理氨和亚硝酸盐 | 好氧菌和厌氧菌共荣共存而成，对氧气要求低。可适用于氧气不充足或无条件暴氧的水体。 |
水质过肥 | 主要的作用是降解氨、亚硝酸盐，水中如有过多的有机质（粪便、残饵），则会抑制硝化细菌的生长繁殖。建议换部分新水后再使用硝化细菌。 | 有效的分解有机质，特别适用于水质恶化严重的水体。 |
pH值 | 弱碱性水体 | 弱酸性、中性、弱碱性水体均可 |
水体清瘦 | 虽是自养型细菌，但生存需要一定的氮、胺，而且水体中的残留氯还会抑制硝化细菌的着床和生长。建议在开缸的第一周每日在水族箱水体中加入适量的光合细菌，来分解有害物质。 | 含有多种活菌，如光合细菌，可适用于新开缸水体和清瘦水体。一周后再使用硝化细菌效果更佳。 |
光照或光线 | 亚硝酸菌对近紫外线的可见光非常敏感，所以使用硝细菌时尽量避免使用把飞利浦865、紫外线灯等灯光。 | 含多种活菌，如光合细菌就需要有效的利用光能。 |
