1、病因：真菌病中危害鳗鱼最为严重的是鳃霉病。另外，在低温季节，由于烂鳃或鳃组织受机械、药物或环境突变等应激刺激后黏脏，所黏脏物易感染水霉，给鳗鱼带来严重的后果。
真菌病一般于相对低水温期易发生，真菌通过其游动孢子传播，对于正常的鳃组织，孢子无法感染，而仅当鳃受到寄生虫、机械等损伤后游动孢子方能感染。由于真菌以寄主组织为营养，因而对鳃组织的危害极大，严重感染者死亡率极高。当真菌感染时鳃组织损伤容易导致细菌的合并感染，当细菌与真菌合并感染时，生物间的相互竞争，导致相互抑制。
2、诊断：患病鳗鱼呈烂鳃症状，但黏脏及鳃丝溃烂更严重，解剖可发现鳃丝红白相间，烂鳃严重。黏脏，轻刮黏脏处的脏物不易完全刮除，取黏脏处鳃丝观察可发现大量真菌菌丝，即可确诊。
3、症状：病鳗起始外观表现为鳃孔周围充血，胸鳍发红，轻压鳃部从鳃孔流出黏脏液；后鳃丝水肿，整条鳃丝溃烂，上皮细胞脱落，结构丧失。病鳗常于水流缓慢处池底静卧，或于增氧机附近池底静卧。
4、防治：由于真菌除外菌丝外还存在内菌丝，因而杀灭相对较困难。现常用杀真菌药品为染料类的亚甲基蓝；铜剂中的硫酸铜、蓝天使。但这些药品应于水中保持一定浓度及时间，浓度与时间还应于水温相对应。另外，在一定的盐分下，淡水真菌在药物的作用下更易死亡。因而在制定治疗方案时，应根据病原感染情况、水温和鱼体体质制定相应措施，亦可采用不同药品的互补作用进行处理。在本病的处理中，应当彻底杀灭真菌后方能进行细菌处理，这个原则一定要遵守。真菌的处理时间一般应达3天以上，如果不能完全确定，应持续1天左右，以避免错误判断而带来的危害。
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