硝化细菌和EM菌在水产养殖中改良水质、降低氨氮、亚硝酸盐、分解有机物、提高水产动物免疫力等方面有突出的作用。但是任何一种菌种都有其自己的食性、生态位特点，这就要求我们必须找到其自我特点，用其所长，避其所短。
现将硝化细菌和EM菌的特点和区别列举如下，以使用户能更科学的使用这些活菌制剂。
解码硝化细菌和EM菌：
硝化细菌和EM菌的不同水体使用效果对比
硝化细菌和EM菌使用注意事项：
相同点：
1、勿与药物同时使用：这两种菌都是活菌制剂，因此使用前、后3～5天内均不得使用杀菌剂、杀虫剂等药物，如使用需间隔3～5天。
2、首次用量加倍：活菌制剂在第一次使用有个世代时间和区位竞争过程，首次用量加倍，以便迅速占领其固有的生态位。
3、需要有“家”（基质或载体）：活菌繁殖必需要有一定的基质，如悬浮的颗粒、有机质等，但也不能过多。
4、水温不适：细菌最适宜生长温度为20～30℃左右，水温过低或过高，均不利于生长繁殖。
5、投放量不足：如大型生态鱼缸或者室外鱼池投放，投放量不足效果肯定不明显。
6、贮藏：活菌制剂应置于阴凉、避光处存放，适宜温度为5℃－30℃，否则会降解细菌的活性，降低使用效果；产品开盖使用后应立即盖紧瓶盖，保持密封状态。
7、水体注入含氯自来水时，应将含氯自来水放置一昼夜后加入活菌制剂。
不同点：
