水华是水体藻类大量生长或聚集并达到一定浓度的现象，是水体富营养化和特定条件综合作用的结果。裸藻是古代原生动物眼虫的植物学名称，因为眼虫同时具有动物与植物两种特性，它是一种“原生动物”，但同时眼虫细胞又有含叶绿素的叶绿体，能够进行光合作用，自己制造营养，所以植物学家认为它是一种“原生植物”。由于眼虫细胞没有细胞壁，植物学家给它起了另外一个名字—裸藻。
裸藻水华多发生在静水、有机质丰富的小水体，水库、河沟、江河等较少见。裸藻适宜生存的温度范围很广，水华形成的适宜温度为20℃-35℃，生长时间横跨春、夏、秋三个季节，尤以6、7、8、9月份生长最旺盛。裸藻水华颜色呈绿色、蓝绿色，这点跟蓝藻引起的水华很像，较难鉴别，可通过测量pH进行鉴定，裸藻绝大多数生长于pH6.5-8.5之间的水体中，而蓝藻大量繁殖时，pH多在8.5以上。另外，裸藻水华有时也会出现红褐色（俗称“铁锈水”）或者酱油色（多发生在养殖中后期和老化池塘）。
裸藻对温度突变很敏感，当遇到恶劣天气或环境变化较大时，裸藻比蓝藻、绿藻等更容易突然集体死亡而发生倒藻现象。裸藻大量死亡后，尸体分解会释放毒素，不仅败坏水质，还会造成鱼虾泛塘、死亡。裸藻水华不易杀灭，实验证明，药物在鱼虾安全浓度内，很难杀灭裸藻。另外，裸藻前端长有一根鞭毛，可通过摆动进行运动，用药物杀灭时，会迅速逃离高浓度药物区域，在药物浓度低的池塘中部或底部避难，待药性消失后，又可重新大量增殖，造成用药后效果不明显。
裸藻大量繁殖的池塘，在当前养殖模式与养殖环境评估中，可以判断水体属于比较清瘦的，因为它抑制了其他有益藻类的生长，使得水体清瘦。裸藻水华的调控方法主要分三类。一是生物方法：培养其他藻类，让藻像复杂不单一；较为经济的方法是混养鲢、鳙、罗非等滤食性鱼类，一般每亩放5-10尾；还有就是投放生物制剂如：FS-活力菌。二是物理方法：经常换水，保持水质清新；每天中午开2小时增氧机（12:00-13:00），增加水体交换；使用絮凝剂如聚合铝等，使用后注意解毒培水；也可进行人工捞取，但是劳动强度较大。三是化学方法：调节水体pH，利用裸藻对pH敏感的特点调节裸藻生长；调节盐度，裸藻大部分生长在淡水中，可在裸藻集中区域泼洒粗盐（8-10斤/亩）进行抑杀，前提是必须使用过絮凝剂絮凝；使用消毒剂或灭藻剂在裸藻集中区域泼洒杀灭。化学方法虽然快速，但千万不可在裸藻衰败期使用，以免造成人为倒藻、泛塘。
