土壤消毒应该使用溴甲烷、威百亩、硫酰氟、棉隆、石灰氮等，也可用阿米西达蘸苗盘，喷施穴窝，然后移栽。也可以用多菌灵、福美双、硫酸铜等进行土壤消毒，每亩用量1~4公斤撒施。
生石灰一般不能用于土壤消毒。生石灰施入土壤后变为氢氧化钙，属于强碱性物质，使用多时理论上有杀菌效果，但是能影响作物根系的生长，一般用于土壤局部消毒，不建议大量大面积使用石灰粉消毒。
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