有机蔬菜生产，最让人头痛的就是杂草防除。由于有机蔬菜禁止使用基因工程产品和化学除草剂除草，主要除草的措施是人工除草。人工中耕除草针对性强，不但可以除掉行间的杂草，而且可以除掉株间的杂草，干净彻底，技术简单。除草时，要抓住有利时机除早、除小、除彻底，不能留下小草，以免引起后患。然而在蔬菜作物生长过程中，可能需要进行多次人工中耕除草，劳动强度较大。在人工除草的同时，可通过一些辅助方法减少杂草，从而减少劳动量。
（1）栽培管理控草。通过采用限制杂草生长发育的栽培技术（轮作、种绿肥、休耕等）控制杂草；有机肥要充分腐熟，因为有些有机肥里含有杂草种子；利用前茬作物对杂草的抑制作用，在安排作物茬口时，让前茬作物为后茬作物创造有利的生产条件，一般胡萝卜、芹菜等生长缓慢，抑制杂草的作用很小，葱蒜类、根菜类也易遭杂草危害，而南瓜、冬瓜等因其侧蔓能迅速布满地面，杂草易于消灭，甘蓝、马铃薯、芜菁等作物抑制杂草的作用也较大。此外，还可喷施酸度为4%~10%的食用酿造醋，既可以消除杂草，又可对土壤消毒，在杂草幼小时喷施效果较好。
（2）覆盖抑草。将作物秸秆整株或铡成3~5厘米长的小段，均匀地铺在植物行间和株间。覆盖量要适中，因为覆盖量过少起不到控草作用，覆盖量过大则可能发生压苗现象，并且影响下茬播种。每亩覆盖量约400公斤，以盖严为准。秸秆覆盖还要掌握好覆盖期，如生姜应在播后苗期覆盖，9月上中旬气温下降时揭除；夏秋大蒜可全生长期覆盖。覆盖前要先将秸秆翻晒，覆盖后要及时防虫除草。此外，可采用地膜覆盖抑草，盖地膜时要拉紧、铺平，达到紧贴地面。利用黑色地膜覆盖，抑草效果最好，但不可用除草地膜（因其含有化学除草剂）覆盖除草。
