有机肥要腐熟后施用新鲜的猪牛栏粪、人粪尿、绿肥和农作物秸秆等,施后在腐烂过程中,会产生大量有机酸、氨气、硫化氢、氮氧化合物等,不仅会危害蔬菜根系,而且逸出土壤的氨气、氮氧化合物等,积聚在大棚内,会给蔬菜造成毒害。
要因土施肥常用的氯化钾、硫酸钾、氯化铵、硫酸铵等,施入土壤后,离解出硫酸根离子、氯离子等被吸收利用很少,在一般菜地、大田施用时,会随水淋失,减轻弊害。但在大棚内,常被积聚在土壤中,加重酸性土壤的酸化,故酸性土壤不宜施用,可施在碱性土壤上,而钙镁磷肥、石灰氮等属于碱性肥料,不宜在碱性土壤上施用,可施用在酸性土壤上。