1.环境变化造成适应缓慢
苗子定植后的根系从育苗基质一下子移栽到土壤中，这就需要有一个逐步适应的过程。一旦土壤环境恶化严重，苗盘基质中的根系不能适应土壤环境，苗子根系就很难下扎。
大棚种植时间越长，土壤环境也就越来越恶劣，都会或多或少的存在很多不良问题，定植后的蔬菜苗子，会因为从基质到土壤出现的巨大环境变化，而导致出现根系生长不良。健康平衡的土壤环境是蔬菜苗子移栽后顺利扎根的基础。
2.肥料过于集中
肥料过于集中，浇缓苗水以后会出现土壤溶液浓度过高的情况，根系在高浓度的土壤溶液中发生质壁分离，从而出现缺水的情况，最终导致根系死亡。
3.地表温度过高
适宜根系生长的土壤温度一般在20~22℃之间，夏季强光直射，蔬菜定植后要进行适当的遮荫，不仅是减少叶片蒸腾量，更要使土壤温度保持在适宜根系生长的条件中。
另外，苗子本身根系生长差也是导致定植后难以扎根的原因，来苗后要仔细观察苗子根系的生长情况，健壮的根系表现为根毛洁白、发达，对于根毛少且发黄变褐的苗子最好不用。
