1、药害蔬菜的秧苗柔嫩，耐药性差，农药使用不当，易产生药害。发生药害的主要原因是农药选择不当，浓度过高，配制不均，喷药时间不当，施用时用量过多。防止药害的方法是要根据不同的病虫害进行对症下药，浓度要适当，配制时充分搅拌均匀，喷施雾点细而匀，不能集中局部地点喷施过长时间，以叶上有水滴下即可。如发现喷施浓度过大，应立即喷清水，避免发生药害。喷药时间宜在上午通风1～2小时后进行，严禁晴天闷棚时喷药。
2、肥害肥害是由于营养土配制不当，加入过量氮肥或腐熟不充分的有机肥，或根外追肥浓度过高而引起的。蔬菜苗发生肥害时出现落叶、烂根现象。应合理配制营养土，使用腐熟的有机肥，氮、磷、钾肥合理配合且要搅拌均匀。根外追肥时肥料浓度的配制要适当。追肥应在晴天早上通风1～2小时后进行。追肥后及时通风排湿。一旦发生肥害应立即喷水，并通风去湿。
3、草害由于苗床环境温暖湿润，床土肥沃，苗床易长杂草。杂草一方面与蔬菜苗争夺苗床养分；另一方面给蔬菜苗带来病虫害。要防治杂草害，首先应严格堆制营养土，使杂草种子在堆制期间死亡；在发生杂草害时可进行人工除草。
