菌核病是近年来沿海地区早春大棚茄子上的重要病害，从苗期至成株期均会发病，以开花结果初期危害最重，常造成门茄、对茄的花蕾和幼果腐烂脱落，主茎及分枝枯死，早期产量锐减。
发病症状苗期发病始于茎基部，病部初呈浅褐色水渍状，湿度大时长出白色棉絮状菌丝，致茄苗软腐而死。成株期叶片受害，初呈水渍状，后出现褐色圆斑，湿度大时长出白色菌丝；花蕾、花柄受害，先呈水渍状湿腐，后脱落；果实受害通常始于果面残留的花瓣处，初呈水渍状，后呈黄褐色腐烂状，湿度大时长出白色菌丝，后期形成菌核；茎部受害，主要发生在门茄果柄着生处附近或对茄所在侧枝上，多由开败的花或幼果上的病菌扩散所致，病部初呈水渍状且上下扩展，稍凹陷，后呈浅灰黄色，皮层腐烂，后期纵剖茎秆可见髓部有黑色鼠粪状菌核，植株自受害处向上枯死。
发病规律茄子菌核病为真菌性病害，病菌主要以菌核在土壤中越冬，茄子定植后菌核萌发，抽出子囊盘，散发子囊孢子，随气流传到寄主上，从伤口或自然孔口侵入形成初侵染。之后病株与健株接触，或病花、病果软腐后落在健部均会引起发病，成为再侵染的途径之一。早春连续阴雨，棚内低温高湿发病重。
防治措施（1）苗期预防。用52℃温水浸种30分钟，播种时每平方米苗床用50%多菌灵可湿性粉剂8克配成药土，下垫上盖。加强苗床越冬期管理，晴天注意通风散湿，低温寒潮天气及时覆盖保温。（2）合理定植。定植前深翻20～25厘米，埋没菌核；合理密植，行距55～60厘米，株距35～40厘米；畦面全面覆盖地膜，阻止子囊盘出土。（3）降湿抑病。选用无滴膜覆盖，减少水滴；早春宜选晴天上午施粪肥，阴天或下午不能施；晴天上午保持较高棚温，让水珠雾化，下午适当延长通风时间，夜间覆盖保温，防止叶片结露。（4）灌根蘸花。定植后用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液灌根，每株用药液200～250毫升。在配制的防落素或2,4-滴蘸花液中加入适量腐霉利或异菌脲。（5）清理病株。及时拔除病株，剪下病枝，打去病叶，疏掉病花烂果，带出田外集中深埋；发病初期的门茄或对茄，先清理果面病部，后用适量多菌灵或甲基硫菌灵洒于伤口，果实仍可继续生长。（6）喷药防治。发现中心病株后，可用50%腐霉利可湿性粉剂或50%异菌脲可湿性粉剂加水喷雾，重点喷花和幼果，每隔7～10天一次，连续防治2～3次。（7）烟剂熏蒸。遇连续阴雨天发病时，可每亩用10%腐霉利烟剂或45%百菌清烟剂250～300克，于傍晚均匀布点，闭棚熏一夜，每隔5～7天一次，连续防治2～3次。
