目前，很多蔬菜种植区的蔬菜秸秆和烂果利用程度低，大多数农民将其直接堆放在棚室周围晒干，然后收集燃烧处理，也有的直接丢弃在路边、河道，这不仅造成养分资源损失，还造成环境污染。
蔬菜秸秆中的氮磷钾养分含量比小麦玉米秸秆高，水分含量高，容易分解，是很好的堆肥原料，但让菜农头疼的是蔬菜病原菌难以杀除。利用高温堆肥就可以充分利用蔬菜秸秆的养分和水分，并能迅速而彻底杀除有害病原菌，实现无害化处理。制作好的堆肥与普通畜禽粪肥相比，其碳氮比高，有机质含量增加，长期施用堆肥可以增加土壤养分保持能力，具有缓释性。堆肥还能显著改善土壤的团粒结构，防止土壤板结。因此，将蔬菜秸秆或烂果进行堆肥，是合理利用蔬菜秸秆、将农业废弃物无害化处理和资源化利用的有效途径，对蔬菜安全、清洁生产具有重要意义。
将堆肥物料按照一定的条件进行配比，物料水分含量在55%-65%，碳氮比在
25∶1-40∶1，pH在4-6，最佳为7.5左右。堆肥过程需控制升温、中温的发热阶段、高温阶段和降温、后熟的降温阶段，获得堆肥。蔬菜秸秆高温堆肥的具体操作方法：
1.选择场地。在温室旁边的空闲地上挖宽1.5-2米、深0.5-1米、长度根据堆肥物料的多少而定的坑；或者在平地上，四周垒出0.5-1米高的砖，砌成水泥池。
2.粉碎秸秆。堆制前将蔬菜秸秆上的绳、铁丝等物品去掉。为了加快腐熟，缩短堆肥时间，将蔬菜秸秆、玉米秸秆或其他作物秸秆轧切成小于5厘米左右的小段，特别是辣椒秸秆纤维含量和木质化程度高，堆肥前必须用粉碎机粉碎，以加快腐熟速度。
3.用料及配比。将番茄秸秆或辣椒秸秆、玉米秸秆、新鲜鸡粪按照1∶1∶1至2∶1∶1的比例进行混料，调节物料水分含量在55%-65%。感官上判断的标准是用手攥物料，水从物料中滴出但不成水流的状态。为了加快物料升温和腐熟，可添加秸秆腐熟菌剂，如秸秆腐解菌、“301”菌剂、腐秆灵、“HEM”菌剂、酵素菌、VT菌剂等，每吨秸秆的菌剂用量为5公斤左右。新鲜鸡粪也可以用尿素(或200-300公斤腐熟的人粪尿)代替，以满足微生物发酵所需的氮素。
4.堆制方法。堆体宽度一般要求为1.6-2米，堆高1-1.5米，长度以材料多少和场地大小而定。物料可以混合后放入堆肥池，也可以分层堆积，一般分3层堆积，一、二层厚各40厘米，第三层厚20厘米，层与层之间和第三层上均匀地撒上秸秆腐熟剂和鲜鸡粪的混合物，秸秆腐熟剂和鲜鸡粪的混合物的用量比自下而上为4∶4∶2。堆好后用泥封严或用塑料布覆盖。堆肥期间堆体温度迅速升温，温度在65℃-70℃之间保持10天左右，堆肥第十天、第二十天分别翻堆1次，堆肥持续20-25天即可完成无害化处理，再继续堆制10天左右，完成后腐熟阶段即可还田。
