工厂化养殖是未来水产养殖的重要发展方向，目前在北方市场发展的如火如荼，那么工厂化养殖的核心是可控，可控的目的是为了水产动物生长病害及成本的可控，具体就是苗种、水质、饲料、健康（保健）、疾病、养殖管理的可控。目前工厂化养殖主要有以物理过滤方式为主的机械工厂化和以鱼菜共生类似方式的生态工厂化。以某工厂化养殖场案例为例，鱼菜共生系统投资300万，其中180万用于实时预警、监控、检测及自动化修复系统（以软件为主）。但实际运行过程中发现，单一方法不凑效，物理方法成本高，化学方法鱼菜生长受影响，生物方法起效慢。
工厂化养殖的水质控制思考
水质可控，很多人认为这是工厂化养殖成功的核心之一。甚至出现了不需要消毒就可以养成的很多案例，那么工厂化养殖到底需不需要消毒，应该如何消毒？我们首先看看目前的现状，全国现在养虾对于微生物的使用都已全盘接受，不管哪种模式、不管养殖户还是经销商都会重点推广使用有益微生物来调水，以达到“以菌抑菌”的目的，但是有纵观几年的疾病都有意思：不但没有减轻，反而呈现更大规模的暴发，同时疾病呈现急性化的特性。那我们就会问，以菌抑菌到底还走得通吗？经销商、养殖户和厂家都在不停的想：到底是什么引起了细菌、病毒的高速繁殖？有的说是苗种，有的说是水体，甚至去搞发酵饲料，到底原因在哪里？乱花渐欲迷人眼，但至少我们有一个方向是明确的：要寻找细菌和病毒生长快速的原因所在。
和水体细菌有关的大类产品，基本只能定位微生物，因为底改、解毒、营养、肥水都没有明确的涉及到如何针对水体中的细菌，而在微生物推广历程中，微生物产品的调水、保水、养水概念是先期提出和推广的，而且在推广过程中我们也不停的去强调在养殖区域里坚持使用有益菌，可以从生态位竞争的层面上有效抑制有害菌的繁殖——以菌抑菌，但为什么有益菌的大范围使用仍然不能阻挡有害菌的繁殖呢？而且疾病来的越来越猛烈，几乎三天都撑不住，更不知道什么病因——细菌、病毒、营养缺失还是苗种，抑或天气？大多数一塘虾死光了还不知道这么回事！最为大家接受的“以菌抑菌”的这个概念存在着很大的漏洞，以菌抑菌是不错的，但是需要做出补充，否则这条路可能存在极大的隐患。随着养殖时间的延长，一个固定养殖环境中的生物总数总体上应该是增加的，不管是有益菌还是有害菌，在未达到环境大变化之前，都是呈现总量上升趋势。有益菌只是抑制了有害菌的繁殖，并不是让有害菌停止繁殖。水体中有害菌可以适应有益菌的环境。水体中有害菌与病毒的种类远超我们的认知，往往是很多疾病无法检测出来的。多种有害菌在一起，容易产生协同作用，在致病后会引起混合型疾病，更难治疗。
有害菌会在水体中缓慢繁殖——抑制不是杀死，所以有害菌生长是必然，只是缓慢罢了。不断的使用有益菌，可能会使得有害菌在环境中的比例未能增加，但是随着养殖时间的延长，环境中的生物数量会增加——出现的结果是比例未变，但有益菌、有害菌的数量都会增加，其中的有害菌当增加到致病数量后，更是会出现连续指数级的增加，而且有害菌此时已适应了有益菌的这种包围，所以疾病呈现了快速急性化的特征。对于能检测出来的细菌，我们可以通过检测明确得知，但是以弧菌为例，近两年往往水体中的弧菌是检测不出来的或数量极少的，虾子仍然在发病，为什么？原因可能有两个：第一，弧菌变异了；第二，新的致病菌的生成，我们检测不出来。后者的可能性会更大些。
综上所述，那么我们就需要对“以菌抑菌”这个方法做出重要的补充，具体可以定期通过一定的方法来杀灭一部分有害菌，以真正防止他们的数量达到致病的临界数量。比如稻田中的野草，在不能清除的前提下，我们唯一最有效的方法就是：长一茬割一茬，只有这样，野草不能繁殖起来，对稻子的影响是最小的。比如市面上现有的蛭弧菌，可以针对性的杀灭某些弧菌，但对其他细菌和病毒的效果就几乎没有了。
那么现在摆在我们面前的问题，我们的建议是工厂化养殖的水质调节需要定期进行消毒处理。疾病的酝酿到发生是一个由致病微生物从量变到质变的过程。消毒就是经常不断的将致病微生物的数量清除到不能引起疾病的程度。建立严格的消毒规范，实际上就是不断的维持动物与微生物和谐相处。
消毒剂的困惑？
消毒剂的选择是一个难点，我们常用的消毒剂包括氯制剂、溴制剂、醛制剂、氧化剂等，这些产品全部都具有一个缺点：强烈的刺激性，会伤藻伤水。当然国家标准的聚维酮碘、过硫酸氢钾的刺激会小一些，但聚维酮碘也存在着溶液及游离碘的双重刺激，因此，定期消毒可能就成了两难问题：不消毒，有害菌在偷偷繁殖；消毒，伤藻伤菌——不知道如何是好。
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