一、可以使用微生物制剂的几种情况
1.1底部的淤泥过厚的池塘；池塘底部淤泥的形成的原因：水产养殖过程中长时间的投饵所产生的剩饵和粪便、肥水使用的有机肥料残留、动植物死亡的有机残骸等。这些堆积过厚的淤泥就是有机物质层，在养殖过程中如果遇到高温季节或者突变天气，有机质层会大量消耗水体中的溶氧和释放大量有毒物质，对水产动物造成毁灭性伤害。这种情况的池塘可以使用的微生物制剂：EM菌、复合芽孢杆菌、光合细菌、硝化细菌。因为微生物可以将过多的有机物质分解利用，使大分子有机物分解成为生物可以直接吸收的小分子无机物，通过长期使用可以降低淤泥厚度。
淤泥过厚
1.2氨氮、亚硝酸、硫化氢超标的水体；水体中如果溶氧不足，过多的有机物质在厌氧发酵的条件下很容易形成氨氮、亚硝酸、硫化氢等，这种情况的池塘在治理方法上，先治标后治本。具体方法：先换水及时降低有毒物质浓度→增氧维持水产动物的正常呼吸和氧化一部分有毒物质转为无毒物质→再使用氧化剂氧化耗氧有机物→等水体指标基本恢复正常后再使用微生物制剂进行治本，EM菌、光合细菌、复合芽孢杆菌、硝化细菌都可以分解过多的有机物质。
少量死鱼
1.3颜色异常的水体；颜色异常的水体形成的原因：有的是藻类形成水华造成的，有的是有机肥或者稻草秸秆溶解在水体中微小有机质造成的，有的是浮游动物大量繁殖造成的，有的是金属物质过量造成的等。如果是藻类、浮游动物、微小有机质造成水体颜色异常，可以通过往水体中添加微生物制剂来与藻类、浮游动物争夺营养物质来控制这些生物的数量，达到净化水质的作用。
茶褐色水体
1.4摄食和消化情况不好的水产动物；水产动物摄食消化不良可能是食物在水产动物的消化道中消化的较慢或者不能消化，水产动物可能存在消化道缺少有益消化菌的原因，或者食物缺少有益菌的预消化，导致不能很好的吸收。对于这种情况可以在投喂的饵料里均匀拌微生物制剂来帮助水产动物消化饵料，芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌，这些有益菌可以帮助消化道消化饵料，解决水产动物摄食和消化的问题。
食台中未摄食完的饲料
1.5疾病多、免疫力低下的水产动物；养殖的水产动物如果经常性的感染疾病或者长期免疫力低下的，可以在养殖水体中添加微生物制剂。一方面微生物制剂可以很有效的改良水产动物生存的水体环境，另一方面微生物制剂可以消灭掉水体中一部分有害微生物，同时微生物制剂能有效提供给水产动物一定的益生元增强水产动物的免疫力。
死虾无害处理
1.6配合使用有机肥肥水；有机肥肥水在水产养殖中是一门很有技术的操作，有机肥必须完全发酵才能下水，但是发酵好了的有机肥同样存在有机物营养释放缓慢，肥效迟迟不出来，同时耗氧分解的有机肥会给水体安全带来极大的风险。如果需要较快的速度出肥力和减少有机肥堆积带来的危害可以使用微生物制剂，EM菌、光合细菌、复合芽孢杆菌都可以帮助分解有机肥释放无机营养盐肥水。
施发酵好的有机肥
1.7作为水产动物开口稚苗的饵料。微生物制剂本身就是一种含有较高营养成分的微小菌类，酵母菌、光合细菌、EM菌、芽孢杆菌、乳酸菌这些菌类是很多水产动物稚苗的开口饵料，比如：螃蟹幼苗孵化、南美白对虾幼苗孵化等，这些有益菌都可以被其摄食消化，因此在孵化过程中可以适当添加微生物制剂作为饵料补充。
虾苗
二、几种微生物制剂的使用方法
使用微生物制剂一定要注意：
2.1水温温度不能低于15℃，最适水温为25℃左右，温度过高和过低都不利于微生物菌的活动和生长繁殖，从而影响使用效果。
2.2水质不能太瘦，太瘦的水体容易使微生物菌类没有足够的营养物质来摄食维持生存，同时，太瘦的水体中的生物种类较少，容易破坏水体中简单的生物系统。
水体过瘦
2.3使用微生物制剂要选择晴天上午有微风的时候，在晴天上午的温度适中，光照充足，溶氧充足，微生物菌容易快速繁殖和活动，效果明显，同时，对水产动物的影响降至最低。
2.4使用微生物制剂最好开启增氧机，微生物菌很多都是耗氧分解有机物质的，一些不耗氧的菌类不需要氧气维持生命活动，但是其分解有机物质的过程中有机质是需要消耗氧气，为了避免水产动物缺氧，以及更加充分搅动微生物菌类和有机质的混合，开增氧机必不可少。
开启增氧机
2.5避免在使用微生物制剂的前后使用消毒剂、中草药、杀菌剂和对微生物菌有害的化学制剂。
·可以自行培养的微生物制剂
光合细菌，养殖户可以自行培养光合细菌使用，仅需要购买光合细菌菌种和培养基就可以了。将培养基按使用说明书配好装入密闭透明的容器，接种光合细菌菌种，密封之后利用太阳光或者电灯光源自然繁殖即可。这种方式培养光合细菌成本低廉，效果好，使用方便。也可以购买光合细菌产品，使用前用红糖水活化即可使用。
阳光下培养的光合细菌
·使用前需要活化的微生物制剂
芽孢杆菌、光合细菌、EM菌、酵母菌、乳酸菌，这些微生物制剂以水剂或者粉剂的产品出现，厂家在生产包装的这些产品含有高密度的菌，在使用之前是以一种休眠的方式的维持生命的，当我们使用时必须要用红糖水或者厂家给的活化剂来活化这些菌类，让其从休眠状态转变到活跃状态，利于提高使用效果。
红糖水
·配合多孔材质使用效果更佳的微生物制剂
硝化细菌，硝化细菌需要更大的接触面积和需要更多的氧气才能将亚硝酸转化成硝酸盐被植物吸收，因此沸石或者一些塑料小管可以给硝化细菌提供更多的附着点，让其与亚硝酸盐有更多的接触提高转化效率。
沸石颗粒
