在养殖过程中除了要注意日常养护管理之外，一些常见的水质与病害问题不容忽视。
1.转水和倒藻问题：在炎热的夏天，藻类生长旺盛，水体营养物质不能够满足藻类生长繁殖所需，水质老化，在天气变化较大，雷暴雨天气、极易引起藻类大量死亡，同时，有害细菌大量滋生，原生动物大量繁殖，也会导致水体变清，危害：倒藻后水体变清，池底有害菌大量繁殖，藻类死亡会使对虾出现中毒，对虾摄食死亡藻类会引起肠道疾病。藻类死亡会使水中溶解氧下降，虾出现缺氧浮头。处理方法：①使用EM菌来稳定水质，控制有害藻类大量繁殖；②定期使用氨基酸微生态肥料，为藻类提供营养，防止藻类老化。③对于原生动物引起的倒藻现象，可以通过停食几天，然后进行肥水培藻。
2.底热现象：在高温季节很多虾塘会出现“底热”现象，出现底热的虾塘容易出现底部缺氧，引起对虾缺氧浮头。原因：在夏天池塘上层水温度比下层水的温度高，增加了上下水混合的阻力，从而形成“温跃层”，使得上层的氧气不能传输到底部，下层的营养盐也不能补充到上层，底部厌氧菌发酵，出现底热。预防方法：①加大增氧，使用“底生氧”进行增氧改底。②使用“臭氧水安”（其主要成份是过硫酸氢钾复合盐），氧化底泥，消除底部有害菌。
3.蓝藻问题：养殖水体中微囊藻等蓝藻过量繁殖，常导致水体透明度下降，当藻类大量死亡时，会大量释放藻类毒素，且死藻经细菌分解产生大量氨氮，亚硝酸盐、硫化氢等有害物质，引起对虾中毒死亡。防治方法：①科学投喂，控制投饵量。②出现蓝藻繁殖过多时，使用“蓝藻净”杀灭水体中的蓝藻等不良藻类，其成份是有机螯合铜研制的新型水质改良剂。用量为500g-700g/亩·m，隔天解毒，同时使用芽孢杆菌，注意增氧，可以有效杀灭抑制蓝藻的大量繁殖，并且净化水质。
4.水质与底质调控处理问题：①池塘水质，前期要养藻，中后期要养菌，达到池水菌相平衡，水质自然就好，这就需要在平时定期添加一些有益菌，如芽孢杆菌、乳酸菌、EM菌等有益菌是可以分解水中的有机质和残饵粪便，也可以定植在肠道内辅助消化吸收转化，降低粪便中有害物质含量，同时还能抑制肠道中有害菌的滋生，达到保健的目的，从源头上解决对虾排泄物对底质和水质的污染。②池塘底部环境是对虾生活居住的场所，底质好坏是养殖成功与否的关键所在。尤其是高温期的残饵粪便，死亡的藻类和原生物，都会沉降在池底，腐败发酵，造成底热，底泥发黑发臭，所以在处理底质改良方法上要围绕“养底”这一核心思想进行，建议不要一直使用氧化型改底，长时间的使用会造成底质板结老化，可采用以芽饱杆菌为主的生物型改底方法，能有效地达到以菌抑菌，以菌改底的目的，可间隔使用氧化型或增氧型活性钙改底，达到清爽池底，改善池底溶氧状况。
5.细菌性防控疾病：在炎热的夏季，水温较高，藻类代谢旺盛，不断出现藻类老化死亡，尤其是有时连续性阴雨天，使得弧菌等有害菌大量繁殖，或在大暴雨之后，对虾由于应激造成体质下降，极易被病菌感染患病，患病对虾一般都会出现摄食量下降，病情严重时会出现空肠、空胃，肝胰脏肿大或萎缩症状。其防治方法：①定期使用噬菌蛭弧菌微生态制剂，蛭弧菌通过裂解宿主细菌而直接起到免疫保护作用，若是使用氯制剂等化学消毒剂，应在消毒6小时后，使用“臭氧水安”有效地抑制弧菌，嗜水气单胞菌、假单胞菌等有害菌滋生，将有害菌含量降到最低程度，减少疾病发生。
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