水霉、锚头鳋、小瓜虫病和肠炎是笋壳鱼的常见疾病，防治方法是不要在低水温季节投苗，养殖过程定期消毒水体，每亩可用1克/立方水强氯精泼洒或施放除虫药物。肠炎主要由饲料腐败引起，投喂冰鲜鱼要去内脏经清洗后投喂，经常清洁和消毒食台，可定期拌喂酵母和土霉素提高抗病能力。笋壳鱼耐药物毒性能力强，使用高出标准值1～2倍的药物未见其有损害。
造成笋壳鱼成活率低的另一原因是在运输、转塘分养时表皮容易受伤感染。笋壳鱼鳞片呈梳齿状，倒刺性极强，在捕捉时相互磨擦导致表皮损伤而不易察觉，因此在养殖过程中尽可能减少中间起捕和避免徒手捕捉。必要的养殖转移时，鱼种用10克/立方水的高锰酸钾溶液浸泡2小时消毒伤口，然后转入有10克/立方水聚维铜碘、8‰盐度的水池或塑料桶中再浸泡暂养2天，消毒水要现配现用，每天更换1次，并保持充氧过程，经过这样的表皮损伤康复，才可转入正常养殖。（珠海市斗门区海洋与渔业管理总站梁健文朱建洪）
