随着科学技术的不断进步，生物学家已经可以应用生物学技术在细胞或细胞超微结构的水平研究对虾的病变和病毒结构。
1、现场目视观察法
现场目视视察法是通过了解养殖过程中对虾急性和慢性死亡的情况，结合濒死对虾是否头胸甲出现白斑、病虾甲壳变软易剥离、虾体发红或肝胰已病变等对虾暴发性流行病的典型症状进行判断。这种方法可在现场情况紧急且没有其他诊断手段可以使用时应用，以便采取抢救措施、减少损失。
2、电镜观察法
电镜观察法是最为直观的检测病毒性病原的方法，但电镜观察法具有操作复杂、需要严格的实验条件和较高超实验技术，以及样品处理时间长等缺点，不能用于生产实践中病毒病的快速诊断以及大量检品的检测，仅适用于生产实践的实验室内进行。
3、T-E染色法
T-E染色法是一种可用于现场诊断对虾暴发性流行病害的方法。取对虾样品组织用T-E染色后，在光学显微镜下观察病变细胞。黄捷等人（1995）筛选出两种既可混合在一起，又能将对虾肝胰腺涂片的细胞核与细胞质分别着色的染色剂台盼蓝和伊红Y（TE）。用含有0.6%台盼蓝和0.2%伊红的混合染色液涂染肝胰腺细小病毒样病毒感染的对虾肝胰腺，观察到核内的病毒包涵体。此法具有快速简单、方便的优点，一般十几分钟内即可得到结果，非常适合于现场诊断对虾暴发性流行病，但这种方法需要操作者具有较丰富的实践经验。
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