首先，大棚内的温度、湿度、光照等环境条件与大棚外的气候条件差异很大，蔬菜在大棚内未经受棚外不良气候条件的锻炼，导致其抗逆性能低，开花授粉不良，种子发育成熟度差。其次，目前大棚里种植的黄瓜、辣椒、番茄、西葫芦等蔬菜，大都利用的是杂交种，杂交种一般只能利用杂交第一代，不能利用杂交第二代。杂交第一代所生产的种子便是杂交二代种。若把杂交二代做种用时，则植株表现为大小不齐，抗逆性差，病害重，生长发育不良，产量降低，品质下降。
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