在进行蔬菜病虫害防治时，为减少化学农药的使用，建议菜农采取生态措施防治。
清园一茬蔬菜收获后，很多病菌附在蔬菜残枝上散落田间，它进入土壤中，成为下茬蔬菜的浸染源。因此，菜农应在每茬蔬菜收获后，彻底清除田间残枝败叶，对易感根系病害的蔬菜还要清除残根。
深耕深耕的目的是破坏病菌的生存环境。一般要求深耕40厘米，借助自然条件，如低温、太阳紫外线等，杀死一部分土传病菌。
消毒在夏季蔬菜换茬间隙，深耕后灌足水，盖上塑料薄膜进行高温消毒，可使土层10厘米处最高温度达70℃，能够杀死大量病菌。
轮作合理轮作不但能提高作物本身的抗逆能力，而且能使浅藏在地里的病源物经过一定的期限后大量减少或丧失侵染能力。
换土对一些较为固定、品种选择余地小而且投资大、效益高的蔬菜设施栽培，如日光温室，可以采用老土换新土的办法控制土传病害。换去根层表土，用无毒表土补充。
嫁接针对某些危害严重的土传病害，采取高抗或免疫的砧木嫁接，可以控制土传病害的危害。如西瓜嫁接在葫芦上、黄瓜嫁接在黑籽南瓜上，可以解决枯萎病等土传病害的危害。
