3-4月份，水温回升至15℃以上时，苦草的种籽非常细小，呈棒形，黑色或黑褐色，籽粒饱满，长度2-3mm，最在直径0.3-0.5mm，每千克种籽约600万粒。生理发育成熟的种籽，在水温18℃-22℃时，经4-5d发芽，约150d，出苗率可达98%以上。刚出苗的幼草即生长大量须根，30d左右时幼草叶片长5-175px，叶宽0.8-25px，叶片肥厚，呈翠绿色或红褐色，叶片丛生于茎节上；当叶片长度达250px左右时，植株基部开始生长1-4根匍匐茎，匍匐茎每一节上均生根发芽，继而长成新的植株，新植株又生出匍匐茎，所以苦草在水底分布蔓延的速度很快。通常一株苦草一年可形成1-3平方米的群丛。苦草的球茎，一般具有2个芽，萌芽生长略早于种籽，生长的植株壮实，分蘖时间也较早。6-7月份是分蘖生长的旺盛期，9月底至10月初最大生物量，10月中旬以后，分蘖逐渐停止，生长进入衰老期。苦草为雌雄异株，雄花形成总状花序，花序外被一层透明膜质的苞鞘，雄花成熟后，苞鞘顶部破裂，花粉浮于水面，是典型的水媒花；雌花具长柄，花基部具有膜质的筒状苞鞘，花萼小形3片，呈绿色，质较硬；花瓣3片，不发达；雌蕊1枚，柱头3个、顶端3岐。花柱基部侧面具有3枚退化的雄蕊，子房下位，内含较多数量的胚珠。苦草的开花期为8月上中旬至10月初，受精后花柄卷曲成螺旋状，收缩将长形的果实沉入水中，至成熟。10月份果实进入成熟期，花柄逐渐衰花，腐败，果实漂浮于水面；此时，果实内有部分种籽尚处于形态成熟期，未达到生理成熟。12月中下旬，绝大多数种籽已生理成熟。通常每个果实内含成熟的种籽150粒左右，少数果实可达300粒以上。人工条件下，10月初果实即进入成熟期，由于存在土壤肥力、水深、水流及管理水平等方面的差异，果实内种籽的数量、饱满程度往往差异很大。
