经常使用化肥的土壤，大多会出现这样的现象，那就是土壤越来越板结。板结后农作物的产量就会逐年下降，农民在种植过程中为了改善这种板结现象，会在土壤中加入农家肥、草木灰，或是农作用的秸秆。养殖水域，底部长期使用强氧化剂、消毒剂，同样会影响底泥层和水体之间物质和能量的交换。比如经常使用硫酸铜、三氯片，这样水体藻类就难以培养，肥度的持久性就要差很多。
使用化肥导致的土壤板结，是缘于过量施肥后，土壤中的氮、磷过多，引起了固氮类细菌、解磷类细菌的减少，通过研究证明，微生物的减少才是造成板结的根本因。同理，鱼塘底长期大量施用如硫酸铜、三氯片，或是强氧化型的改底产品，也会造成鱼塘底部的这些微生物短时间内数量上的减少，如果残留期过长，势必影响塘底微生物的结构，影响塘底底泥的通透性，引起底泥板结，阻断了底泥中，微生物分解产生的短链脂肪酸等营养物质向水体中的扩散。
在鱼塘的抽喂管理中，长期投料后，会在底部沉积越来越多有机质，这些有机质远远超出了塘底土著微生物的分解能力，就会在塘底累积，随着有机质越积越多，塘底的溶氧被有机质消耗的越来越多，最后出现不足，然后氮素循环受阻，亚硝酸盐急剧升高；在厌氧环境下，硫酸盐还原菌大量繁殖，产生剧毒物质硫化氢。因此，为了消除底部有毒物质累积所带来的危害，要进行定期的改底，改底没有错，关键在于怎样改。
