芽孢杆菌（Bacillus）是细菌的一科，能形成休眠体，休眠体由核心、皮层、芽孢衣和孢外壁组成，可在一定条件下变成营养体，进而进行代谢和繁殖。在萌发成营养体之后，能强烈地分解碳系、氮系、磷系、硫系污染物,分解蛋白质和复杂多糖,对水溶性有机物分解也有重要的作用,同时可以与养殖环境中的有害藻类及水产致病菌竞争,形成优势种群,抑制有害藻类及水产致病菌。所以芽孢杆菌在水产养殖中的应用越来越广泛。芽孢杆菌来源广泛，可以使用的菌种很多，主要包括枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、东洋芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、芽孢乳杆菌、丁酸梭菌等。随着芽孢杆菌类产品市场需求越来越大，市场上各种产品也鱼目混杂。特别是在巨大的商业利益诱惑下，很多厂家不择手段，致使产品质量参差不齐，严重危害了微生态制剂在水产中的应用。所以养殖户选择芽孢类产品时，也要学会分辨产品好坏，今天给大家重点介绍一下如何在水产养殖中选择和使用芽孢杆菌。
水产用芽孢杆菌推荐使用水产专用芽孢杆菌，很多厂家使用畜禽肠道筛选出芽孢杆菌，这类细菌最适生长温度一般为37℃，25℃以上仍有一定作用，但20℃以下基本丧失作用。但是这类菌很难适应水产养殖环境，使用过程会出现“水土不服”的现象。水产专用芽孢杆菌筛选自养殖水体、底泥、粪便和水产动物肠道，这样来源的菌种属于水产养殖池塘土著菌，很容易适应水产养殖环境，使用效果也更好。
菌种的筛选一般采用定向筛选的方法，根据需要芽孢杆菌的作用的不同，设置不同的富集培养基，将环境中采取的水质和底泥样品加入到富集培养基中富集培养。假设需要筛选降解氨氮的菌种，我们在富集培养基中加入过量氨氮，这样能够降解氨氮的菌种能够在这类培养基中形成优势菌种，经过多次富集培养和驯化，筛选出具备氨氮耐受性和降解氨氮能力较强的菌株。将这些菌株进行氨氮降解性能测定，从中选出降解能力最强的几株菌。鉴定几株菌的生长速度、耐盐性、耐温性、酶活力等指标，选出效果最好1-2株进行发酵工艺优化。能够适合大规模发酵的菌种才能应用在生产中。
那么具备什么样特性菌种才能应用在水产养殖中呢，经过几年的摸索，我们选取以下指标作为水产专用菌种的选择标准。
1、生长速度快：
在摇瓶中培养，12小时进入对数生长期。水产养殖一般要求产品见效快，产品进入水体后能够快速生长繁殖，并在水体中发挥作用，生长速度慢的菌种往往表现效果较慢，达不到生产要求。生长速度快的菌种一般在显微镜下活力比较强，能够看见明显的蠕动现象。
2、耐盐度范围宽：
水产养殖环境多变，根据养殖阶段、养殖季节、降水量变化等因素会造成养殖池塘盐度变化，不能耐受盐度变化的菌种往往适应性不强，使用效果不稳定。当然在产品配方设计中也要要求能够耐受高盐度的菌种应用在海水养殖池塘，能够耐受低盐度甚至没有盐度的菌种应用在淡水养殖池塘。
3、耐低温：
一般芽孢杆菌的最适温度在37℃左右，发酵温度一般设定为菌种的最适生长温度。水产养殖环境水温一般不会超过30℃，对于一些冷水鱼、海参等养殖动物，养殖水温要求低于20℃，很多芽孢杆菌在20℃以下不会萌发，也就说我们泼到水体中芽孢根本不会起作用。所以在水产养殖用芽孢杆菌筛选中，能够耐受低温是一个非常重要的条件。
4、pH耐受性：
养殖池塘的pH每天都在变化，早上6点钟左右pH最低，下午2点左右pH最高，两者之间差距为1左右。一般pH会偏碱性，常见pH在7-9之间。要求芽孢杆菌既能耐受pH值波动，又要保证在这个区间芽孢杆菌功能不能丧失。
5、氧气耐受性：
芽孢杆菌耗氧不耗氧一直是大家比较热议的一个话题，很多人因为芽孢杆菌耗氧而放弃使用芽孢杆菌，在我看来这是一种因噎废食的做法。其实芽孢杆菌本身耗氧量是很低的，真正造成池塘缺氧的是池塘环境本身。这个话题不在此详述，之前专门写过一篇文章论述芽孢杆菌耗氧量。我们在菌种筛选的过程比较关注芽孢杆菌对于低氧的耐受力，这一点更多是来判断我们在使用的过程中是否需要根据池塘情况来选择芽孢的使用位置，一般不耐低氧的芽孢不会使用在底改产品，一般池塘底部的溶氧量会比较低，不利于不耐低氧芽孢杆菌发挥作用。
有了功效明确，使用效果好的单菌，那么是不是我们在养殖中就是使用单菌即可，没有必要进行菌种复配了呢？实际上单菌即使功能再强大，也不能解决所有的问题，所以产品使用不同菌株进行有效复配，才能生产出高效、稳定的产品。产品复配要求菌种之间要做到以下几点
1、相互促进：
菌种之间要能够相互促进，不能够相互抑制，互相抑制菌种不能在同一产品中使用。鉴别菌种之间是否存在相互抑制，最简单的方法就是十字交叉法，是否存在相互抑制一目了然，详见下图。
存在相互抑制菌种和不存在相互抑制菌种
2、功能互补：
复配菌种间功能是互补的，例如A菌种在降解氨氮方面功效突出，复配降低COD和净水能力强的菌种，产品使用效果会更加明显。这一方面可以使用EM菌复配原则，某一菌种的代谢产物刚好可以作为另一菌种的培养基，这样两种菌种复配到一起会起到1+1＞2的效果。
3、载体选择：
载体的选择对于产品使用效果起到非常大作用，首先不同的载体对于菌种的作用位点是不一样的。以石粉类载体为主要载体的产品，大部分会沉降到池底起到改良池底的作用，以悬浮性有机载体或者水溶性载体的产品一般会大量悬浮在水体中，处理水塘悬浮有机物。不同载体对于菌种生产繁殖也会起到不一样的作用，载体中添加适合菌种繁殖生产的碳源、微量元素等物质，可以明显提高菌种繁殖速度，增加环境中菌量，可以在配方中减少菌种添加量依然可以起到高菌量添加产品一样的效果。不一样的菌种对于营养需求不一致，这需要针对不同的菌种做载体的选择试验。
芽孢杆菌在水产养殖中使用非常广泛，大家在使用时要明确使用目的，选择适合的菌种，避免将菌量高低作为选择的唯一依据，多方位地了解菌种特性，再根据菌种特点优化复配方案，根据养殖池塘的环境特点选择合适的时机使用，才能达到最佳的使用效果。
