根据致病原因的不同，甲鱼发生肠炎一般可分为三种：1、细菌性肠炎；2、应激性肠炎；3、食物性肠炎。每种肠炎的症状也不尽相同：细菌性肠炎的典型症状是甲鱼的屁股会出现红肿，大便浮起；应激性肠炎甲鱼的粪便不成形并且伴有鼻涕状的物质（脱落的肠道黏膜）；食物性肠炎甲鱼的粪便可以发现未完全消化的食物。
无论出现哪一种肠炎，治疗时应先让甲鱼停料一餐或减少投喂量，减轻甲鱼肠道的负担。
这三种肠炎中，较常见的为细菌性肠炎，一般使用抗生素（诺弗沙星）和盐酸小檗碱进行治疗。但是抗生素虽然可以消灭病原菌，同时也会把甲鱼肠道内的有益微生物杀死，而这些有益微生物对甲鱼的消化功能起到了非常关键的促进作用，因此，用药后，更重要的是要重新构建甲鱼肠道内的微生态系统，可以给甲鱼饲喂一些电解多维和产酶益生素，以帮助甲鱼恢复肠道功能。
如果是应激性肠炎，可给甲鱼饲喂电解多维、葡萄糖、产酶益生素和盐酸小檗碱。
如果是食物性肠炎，可给甲鱼饲喂电解多维、葡萄糖、产酶益生素、盐酸小檗碱和大蒜素。以上信息仅供参考。
