大棚蔬菜种植超过4年以上的，土壤积盐程度重，对蔬菜生长极为不利，很多大棚黄瓜因土壤性质变劣，使黄瓜根系生长不良，抗逆性降低，当冷空气来时不能忍受长时间阴冷，因而导致减产。因此，培育健壮的根系是蔬菜提高抗逆性，获得增产的必要手段。而决定蔬菜根系健壮、抗逆性高低的关键是土壤的透气性。只有土壤透气性强，氧气充足，根系的呼吸作用充分，产生较多的能量，根系吸收能力才强，才能长出壮棵，蔬菜抗逆性才能提高，产量才能增加。如何提高土壤的透气性呢？
首先，增施有机肥，秸秆还田，提高土壤中有机质含量，是提高土壤透气性的根本措施。土壤有机质是土壤团粒结构形成不可缺少的主体成分。有机质含量高，土壤疏松，透气性好的土壤，作物产量最高。因此，增施有机肥和秸秆还田对改良土壤、提高土壤透气性是十分必要的。
其次，将大水漫灌改为滴灌，合理浇水。传统的沟灌、畦灌等对土壤侵蚀、压实的作用很强，土壤的团粒结构便被破坏，不利于土壤保水保肥性。而在大棚蔬菜生长起来后，又覆盖着地膜，中耕松土的难度较大，土壤板结也就无法打破。滴灌不同于大水漫灌，它慢慢地浸润土壤，对土壤破坏作用小，使用滴灌的大棚内土壤更加疏松，透气性更强。
再次，重施生物菌肥，提高微生物活性。由于长时间的连作种植，导致土壤中有害微生物积累，而有益微生物就会减少，容易发生根部病害，使蔬菜不能正常生长。有害微生物的积累对土壤性质也有较大的影响。很多有益微生物本身就有改良土壤、提高土壤透气性的作用，在有益微生物繁殖的同时一方面可以疏松土壤，另一方面在分解土壤被固定的营养元素时，也会产生一些促进根系生长的物质，对根系的生长十分有利。因此须通过施用生物菌肥，增加土壤中有益菌的数量，使土壤中的有益微生物重新占据优势。增加生理活性物质，增施有机肥，能促进微生物的活动。由于微生物活动的结果，除了增加土壤中的矿物质营养和腐殖质以外，还能产生多种维生素、抗生素、生长素等，具有促进根系发育、刺激作物生长、增强抗病能力的作用。
